python 聚类找出同一类别的数据
Python实现简单层次聚类算法以及可视化本文实例为大家分享了Python实现简单层次聚类算法,以及可视化,供大家参考,具体内容如下
基本的算法思路就是:把当前组间距离最小的两组合并成一组。
算法的差异在算法如何确定组件的距离,一般有最大距离,最小距离,平均距离,马氏距离等等。
代码如下:
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import numpy as np import data_helper np.random.seed( 1 ) def get_raw_data(n): _data = np.random.rand(n, 2 ) #生成数据的格式是n个(x,y) _groups = {idx:[[x,y]] for idx,(x,y) in enumerate (_data)} return _groups def cal_distance(cluster1,cluster2): #采用最小距离作为聚类标准 _min_distance = 10000 for x1,y1 in cluster1: for x2,y2 in cluster2: _distance = (x1 - x2) * * 2 + (y1 - y2) * * 2 if _distance<_min_distance: _min_distance = _distance return _distance groups = get_raw_data( 10 ) count = 0 while len (groups)! = 1 : #判断是不是所有的数据是不是归为了同一类 min_distance = 10000 len_groups = len (groups) for i in groups.keys(): for j in groups.keys(): if i> = j: continue distance = cal_distance(groups[i],groups[j]) if distance<min_distance: min_distance = distance min_i = i min_j = j #这里的j>i groups[min_i].extend(groups.pop(min_j)) data_helper.draw_data(groups) #一共n个簇,共迭代n-1次 |
运行的效果就是迭代一次,组数就会少一次,调用画图方法,同一组的数据被显示为一个颜色。
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原文链接:https://blog.csdn.net/york1996/article/details/86652330