高校的科研质量在某些程度上可以反映出该院校教师的科研实力。请注意，科研实力和科研质量并不是相同的概念。而用FWCI指数（论文的被引用次数与同类型论文的平均被引用次数之比）评价的科研质量，也是高校科研实力的一部分。国内高校之所以与国外高校对比并不特别突出的原因便是国内院校的科研质量不够，而通过以量取胜，所以对于国内高校来说，提升科研质量迫在眉睫。如果一个高校的FWCI≥1，则说明该院校的论文质量超过了世界平均水平。
清华北大作为国内长期霸占榜首位置的两所高校，科研实力在国内也远超其他高校，但是就科研质量而言，连前五都勉强，起码来说比中科大要差一些。但令人意外的是，有三所四非（非985非211，非双一流院校、专业）科研质量超越中科大，碾压清华、北大，他们分别是南方科技大学、渤海大学与辽宁工业大学。值得一提的是，南方科技大学在2017年世界大学学术排名就位列全国第43位，作为一个建校至今仅有8年的院校，科研质量（FWCI）单指标表排名全国第一，获得这样的成就实属难得。
虽然说南方科技大学的科研质量高是因为它是高等教育改革试验校，建校的目的就是参与国家的重大科学技术研究，但是渤海大学和辽宁工业大学这两所“二本”大学，科研质量却超过了清华北大甚至超越了中科大。这说明这两所大学在科研上水准很高，虽然规模不够大，但是实力强劲。
当然，除开这三所霸占前三的大学之外，中科大的论文质量最好，且论文数量远超前三所“非211大学”，所以可见，尽管南科大、渤大、辽工大科研质量超过了中科大、清华、北大，但是科研实力却不是一个水平线上的，论文的数量差距实在是太大，且硬件配置也是相去甚远。
不过，值得一提的是，在科研质量前100的大学中，相同层次的名校中，论文数量多的高校，往往科研质量不高，例如上海交通大学和浙江大学，论文数量遥遥领先，但论文的质量却并不高，而中科大的数量仅有它们的一半，却领先于他们，可见高校的论文质量与论文数量同样重要。
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