西游记后传，孙悟空成为新的万佛之祖，那燃灯古佛去了哪里。
无天占领三界后，折腾三十三年。不仅通过阿修罗界的作坊，仿制出了玉帝和天界众神，派往天庭。就连佛界众圣也统统被仿制，悟空在灵山所见到的佛界众圣都是冒牌货。就连悟空的火眼金睛也没有识别出，可见无天的手段之高，法力之强。
如来圆寂时，也对众圣说过，“厄运已至，此乃劫数和定数，非我等法力能与此魔相抗衡”。并用一首佛偈，来安慰大家不要怕，不要轻举妄动。因为有一个人，可以解决这场浩劫。就是后来被三藏参悟佛偈时说出的孙悟空，孙悟空可以解决无天带来的这场浩劫。
燃灯古佛也说过，这场浩劫，非比寻常。而且作为万佛之祖，燃灯古佛是先于如来佛祖圆寂。对于三藏来说，燃灯古佛怎会无端涅槃，三藏也是一头雾水。这里说明一点，圆寂或者说涅槃不是意味着死了。
另外，其实无天早在黑暗之渊时，就早已笼络了九头虫和牛魔王等一众妖魔。他还派牛魔王去寻找舍利子，所以那时无天就知道十七颗舍利的存在，和对他的威胁。牛魔王在隐雾山洞中找到了一颗舍利，却被已经圆寂的上古万佛之祖，龙光古佛的真灵封闭洞口，困死在洞中。这也是悟空来到后，发现洞中有一对牛角，正是被困死的牛魔王。
虽然，在无天占领三界后，燃灯古佛早已圆寂。但燃灯古佛在圆寂前，早已把全部舍利的位置和悟空是无骨舍利的事，告诉了悟空曾结拜为兄弟的镇元子，并对镇元子说这事只能告诉悟空一人。所以镇元子也没有辜负燃灯古佛所托，在被假观音骗到南海后，当假观音问起舍利的事。镇元子也只是避而不谈，最后把舍利的藏匿之处全部告诉了悟空。
而且，燃灯古佛的真灵告诉悟空，从上古到他一共十七颗万佛之祖的舍利，要悟空统统找到。而镇元子也没有告诉悟空就是那颗无骨舍利，说到了时候无骨舍利自然会出现。
到了如来重返佛界的关键时刻，接近子时，悟空和无天的法力都发挥到最大时，镇元子说出了悟空是那颗无骨舍利，除了无天很意外，连悟空也很意外。这说明悟空之前已经圆寂过一次，否则他怎么会是无骨舍利呢。无骨舍利能够重生为孙悟空，孙悟空为了消灭无天又圆寂，化为无骨舍利消灭了无天。
最后有奇迹般的回来，被如来佛祖封为新的万佛之祖。那燃灯古佛圆寂后，为什么没有出现在天界。而且他又是如来的老师，悟空都能圆寂两次再回来。燃灯古佛圆寂，为什么没有回来，去哪了。其实燃灯古佛这万佛之祖的地位，也是到了该传给新人的时候。因为上古已经有十五位万佛之祖圆寂，而燃灯古佛让位后，他的真灵回到了真性佛土。
随后换了一个身份，在别的世界度化众生。因为宇宙无限大，需要度化的众生也是无量无边。就像观世音菩萨，很久前早已成佛，佛号正法明如来。现在以观世音菩萨的身份，在西方极乐世界帮助阿弥陀佛，接引念佛往生的众生。
所以，燃灯古佛看似圆寂了，实则是真灵回到了真性佛土，这个地方只有佛与佛才能证悟到的境界。
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