清代官制沿袭明代，与明代相比，中央机构增设较多，而地方除厅的设置外，其省、府、州、县的统治层级设官，基本与明代相同。但在统治制度上，清代比明代有更多完善和发展、补充，呈现出诸多特点，大致有十个方面的不同。
第一，按省设置督抚，事权归一
督抚是明代所设，其设置的初衷也是为了事权归一。明代的督抚，还多不是以省为单位的固定辖区长官，且军事方面的职责较重。清代，督抚成为按省设置的最高长官、综掌权力的封疆大吏，保证了省级重要权力的集中行使，避免了明代时事权分散的弊端，又统辖原布、按二司办理省级事务，因而对地方的统治加强。
由于巡抚偏重文职、民政，总督偏重军事而文职、财权轻，再加上清帝专制集权，控驭有方，所以虽然有集诸权于一身的督抚，但类似唐代藩镇割据的现象并未重演。
至晚清，总督经办洋务，有些督抚兼管外交，比如直隶总督、两江总督等，权力大增，又渐露坐大端倪。不过这只是晚清的事情，终究未发展到割据的地步。
第二，政区化大为小，以便治理
主要体现在三个层级上，一是省级，把陕西分为陕西、甘肃二省，江南分为江苏、安徽，湖广分为湖北、湖南两省；二是省下，大府化为小府，这主要是在雍正年间，实行的办法就是分出一些州县，以划出的州作为直隶州，管辖分出的县，这个直隶州与府平级。
由大划小的府如直隶的正定府，山西的太原府，山东的济南府，四川的成都府等，这些府原来所辖州县，一般在25个以上，最多的西安府为37个。划为小府后，基本维持在16个以下，个别的有18个，规模减小了将近一半。
第三，府州县官员深入到基层实行管理
府州县的佐贰官分防下属基层地方，以划片对该地区乡镇村寨进行重点管理。设巡检司巡检巡缉，加强关津要害之地的治安管理。清代府州县佐贰官的分防基层地方，与巡检对关津要害之地治安管理的结合，深化了基层统治。其实省级藩臬的佐贰官分遣省下以分守、分巡，也是官员下派以加强管理的形式。
第四，以道行使对府、直隶厅、直隶州的巡察监督、盘查稽核及军事统治职能，加强府级的行政管理及统治的稳定
清中期以后，凡是府及直隶州、直隶厅，其上基本都由较固定的某道统辖。另外，专业道像河道、粮道、盐道等的职道也较稳定。这些都是比明代的道发展、完善之处。
第五，厅的大量、广泛设置
厅是清代地方设置的特殊统治机构，主要设于事务复杂、特殊、较难治理的地区。内地直省之中，离府州县治所远、比较难治理地区专门设厅，以强化治理。
民族地区及移民聚居区、民族杂居区设厅，则是在清代民族地区版图扩大、人口剧增，形成多处流寓民地区、少数民族杂居区的情况下，对新的复杂社会条件下的基层实行的特殊管理形式，是清代地方管理颇具特点的制度。
第六，推行保甲，加强对基层的管理
保甲制度在宋代王安石变法的时候实行过，但以后就不再实行了。明代也有保甲制度，现在所知道的，也主要是王阳明在赣南实行过，明末的其他地区也可能实行过。但是从总的情况来看，没有清代推行的时间长、普遍，而且清代推行保甲的制度性比较强。
清代从入关的顺治元年就下令在全国实行保甲制，以后，康熙、雍正、乾隆这几个皇帝都曾下过诏令，在全国范围内实行保甲制，并且制定下发了一些具体的规定，所以保甲制在清代的推行较普及，范围广。
第七，强化对基层百姓的思想统治，宣讲《圣谕广训》、律条，而且把这种制度固定化
这种方式就是所谓的教化，历代都对民众实施教化，但是方式不一，明代也实行过，明初朱元璋也曾令地方官宣讲大诰。清代把它具体化、常规化，定为常行制度，主要是宣讲“圣谕十六条”，这十六条是康熙帝制订的教化百姓的十六个方面，雍正时又把它进行阐释，扩大为《圣谕广训》。乾隆以后，又刊印刻为印刷品，发到各个州县乡村，令州县官组织乡约定期宣讲。
再有就是宣讲律条，将基层百姓容易犯事的一些行为张贴在村寨中，另外也让绅士、乡约讲这些律条。清代科举制度中，还曾规定考生默写《圣谕广训》，以此促使学子们掌握这些教化内容。
第八，八旗驻镇要冲，绿营广置直省，深入细微
八旗兵少，在重点地区、城市设置。绿营则在全国所有省份都设置，而且既有各省提督、总兵以及督抚统辖的营兵驻守各个大小城镇，又将营兵化整为散，以“汛”的形式分散设置到各小市镇、关津要害之处，甚至村寨。可以说是星罗棋布、细致入微，这是对地方基层军事控制的深入化。
第九，专项事务设官有所发展
这些专项事务主要是以下几种：河务、漕务、学务、榷关。这几个方面在以前的王朝地方也设置过专职官，清代之设官，一是较固定，二是所设官级别较高。另外，某些官设置广泛。
河务、漕务官，明代也设，但很长时间内并不固定，有时候河务官和漕务官合为一人，至明后期万历年间才分设。清代开始就固定分为专职的河道总督、漕运总督。学务官，清代所设学政，在布、按两司之上，级别较高。榷关方面，清代因商品经济发展，榷关之官远较明代设置范围广、数量多，晚清时又设置了一些洋关，数量也相当多。
第十，幕宾佐政，胥吏扩大
这是清代地方行政制度的一个重要特点，一个重要原因就是清代地方长官衙署的佐杂少。如督抚、两司、道、府州县衙门，大多没有佐贰官，有的设置又分防到地方去，所以清代地方长官大多雇幕宾佐理政务，以致清代有“无幕不成衙”的说法。
另外，清代地方书吏、胥役也大大增多。幕宾佐政，对行政作用影响可以说是利弊参半，而胥吏的大量增加，则加剧了地方吏治的腐败。
以上的十个方面，基本上就是清代地方官制与明代的不同之处，不过这些都是一个粗浅的介绍，还有一些更为细致的差别这里就不多陈诉了。
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