我们体内平均大约生活着1,000种不同种类的细菌。细菌的总数量很难统计，但应该在数万亿个的级别。我们总习惯性地认为细菌有害。其实，要没有细菌，人是无法存活的。
细菌对人体的作用
人类基因组由大约2万个基因组成，但是我们体内的细菌携带的基因数量却比这个数字多500倍。丰富的基因使它们能够完成很多有益的工作——协助消化食物、制造维生素和矿物质，甚至可以通过排挤或杀死感染菌而避免人体生病。
细菌对人体的作用还远不止于此：它们能够由内之外塑造我们的形象。《人体微生物的奥秘》（I Contain Multitudes）一书作者Ed Yong说："体内微生物帮助建造我们的身体，并且当我们变老时，它们塑造并更新我们的内脏器官。"
"它们甚至可能会影响到我们的行为和思考模式。有很多动物研究发现，动物体内的微生物会影响其情绪、个性和对焦虑和压力的反应。"人体内部的微生物还会对人产生类似的影响。
圣托马斯医院（St Thomas' Hospital）遗传学教授蒂姆·斯派克特（Tim Spector）说，菌群多样性是保持体内健康的一个重要因素，不同微生物会执行不同任务，多样化的菌群能够实现更全面的能力组合。
比如产气荚膜梭状芽孢杆菌（Clostridium perfringens）、E型大肠杆菌数量如果高于平均值，都会引发胃肠道疾病。
产气荚膜梭状芽孢杆菌会诱发胃肠道疾病
而一种称为Akkermansia的肠道细菌和名字如同绕口令般的Christensenellaceae细菌。这两种细菌都可以防止肥胖。甲烷短杆菌（Methanobrevibacter）可以增加从食物中取得的热量，从而减少食物摄入量。草酸杆菌（Oxalobacter）有助于防止出现肾结石。
甲烷短杆菌能够帮助我们从食物中获取更多热量。
益生菌和菌群平衡
“对人体有益的细菌我们叫它益生菌，它可以平衡肠道的pH值，促进体内菌群平衡，从而让身体更健康。”北京小汤山医院健康管理中心主任医师赵润栓说，肠道掌管着人体70%以上的免疫功能。
如果说肠道是免疫力的培训基地，益生菌就是培训员。“肠道菌群按一定的比例组合，各菌群间互相制约，互相依存，在质和量上形成一种生态平衡。”
简单来说，益生菌是一种可以保持消化道有益菌和无益菌平衡的一种活性微生物。关于肠道微生物，有一个占位理论。
也就是说，假设肠道里面有100个位置，其中50个是益生菌，另50个是致病菌。我们摄入益生菌是去抢致病菌的位置的，抢的位置越多，益生菌占比越大，致病菌致病的可能性越小。
常见的益生菌有双歧杆菌、乳酸杆菌和链球菌等，他们与肠黏膜紧密结合，构成肠道的一道屏障，抑制条件致病菌的过度生长，以及阻挡外来致病菌的入侵；同时益生菌刺激肠黏膜分泌黏液及细胞因子，这些物质可以抵御病原菌侵入；益生菌还可以促进免疫球蛋白的分泌，起到提高免疫力的作用。
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