天聪九年，多尔衮因为从林丹汗手中夺得传国玉玺，并敬献给皇太极，身价倍增，但恰逢此时，他的发妻去世，科尔沁的蒙古王公们为了继续笼络这个军事奇才，于是忙着为他张罗新媳妇。经过层层筛选，科尔沁部决定将准皇后哲哲的亲妹妹巴特玛送给多尔衮。
哲哲的母亲科尔沁大妃先后有过两次婚史。第一次嫁给莽古思贝勒，生下皇太极嫡福晋哲哲。科尔沁大妃成为未来大清皇后的母亲，身份十分尊贵。科尔沁大妃第二次嫁给莽古思之孙索诺木，生下两个女儿。天聪七年，科尔沁大妃长女达哲嫁给多尔衮的同母弟多铎。天聪八年，索诺木之子奇塔特与皇太极和嫡福晋哲哲所生之女订婚。科尔沁部决定将索诺木次女嫁给多尔衮。
天聪九年，皇太极称帝前夕，巴特玛从科尔沁来到后金，与多尔衮成婚。多尔衮借此进一步密切了和皇太极的关系。
次年，皇太极称帝，册立巴特玛同母异父的姐姐为皇后，巴特玛的两个姑姑为皇妃（索诺木的妹妹宸妃和庄妃），册立巴特玛母亲为和硕福妃，册立多尔衮为和硕睿亲王，世袭罔替，册立多铎为和硕裕亲王，世袭罔替。成婚之初，多尔衮十分依赖巴特玛的社会关系网，后来他逐渐真心喜欢上这个既温柔又爽朗的蒙古女孩。莽古思家的姑娘们大多十分出众，皇太极皇后哲哲雍容大度，将后宫治理得井井有条。皇太极宸妃贤惠聪敏、善解人意，宠冠六宫。皇太极庄妃智谋过人、富有韬略，日后成为兴国女杰。巴特玛依靠天赋和努力，成为多尔衮心中最值得珍惜的人。
崇德年间，多尔衮继续受到皇太极的重用，立下赫赫战功。巴特玛时常出入宫廷，和皇后皇妃们聊聊家常，或是到裕亲王府看望姐姐，身为亲王嫡福晋，巴特玛生活富有而幸福。崇德三年，皇太极和哲哲之女被封为固伦公主，嫁巴特玛同父异母的哥哥奇塔特。
崇德八年，科尔沁大妃和科尔沁次妃（宸妃、庄妃之母）为祝贺军事胜利抵达盛京，但还没正式到达京城，皇太极就驾崩了，由于科尔沁大妃和次妃的特殊身份，她们在这次事关清朝国运的政权更替中，发挥了极其重要的作用。在她们的斡旋下，多尔衮拥立庄妃之子福临（巴特玛的表弟）为帝，尊巴特玛姐姐哲哲和巴特玛姑姑布木布泰为皇太后。顺治元年，多尔衮带领清军攻入山海关。顺治元年，大清迁都北京，顺治帝封多尔衮为叔父摄政王。多尔衮选明南宫为王府。南宫在明代为皇城东苑，是太子居住的地方。多尔衮在南宫基础上建成摄政王府，成为清初实际统治中心。清初诗人吴伟业曾有诗句：“七载金媵归掌握，百僚车马会南城”。顺治二年，多尔衮晋为皇叔父摄政王。顺治三年,多尔衮将皇帝玺印搬到自己的府中收藏备用。顺治四年，多尔衮不再向顺治帝行礼。顺治五年，顺治帝封多尔衮为皇父摄政王。随着多尔衮权势日盛，巴特玛成为缓和皇帝和摄政王关系的重要人物，为此她心力交瘁。顺治六年，巴特玛姐姐皇太后哲哲驾崩。同年，巴特玛去世。多尔衮为此十分伤心，追谥敬孝忠恭正宫元妃。
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