检测HIV对于筛查，确认和监测感染至关重要。有不同类型的诊断工具可用于检测HIV特异性抗体，病毒抗原或核酸。检测HIV特异性IgG和IgM抗体的第三代酶免疫检测，检测抗HIV抗体和HIV p24抗原的第四代酶免疫检测以及基于核酸的HIV RNA检测是目前最常用的诊断方法；对于HIV感染患者，HIV 病毒载量检测和CD4 细胞计数等是最常用的监控方法；HIV基因分型检测用于检测 HIV 基因组突变，其对研究和改善HIV病毒的药物抗性非常有用；干血斑测试对于幼儿和偏远地区HIV感染疫情的掌握有着独特的优势；一些常用的免疫因子，感染指标，血栓标志物对于HIV感染后期患者监控具有一定指导意义。生物标志物的发展的利用对于病情的筛查、诊断、监控和治疗具有指明灯似的作用，对于控制HIV感染和AIDS的治疗起到了关键性作用。
目前常用的HIV感染指标
1 血清学检测
HIV-1/2抗体
应用：HIV感染筛选和HIV感染确认。
筛选测试方法：酶联免疫吸附测试、化学发光、免疫荧光、免疫层析试纸条、免疫渗滤法等测试方法。
确认测试方法：免疫印迹、条带/线性免疫实验（RIBA/LIA）、间接免疫荧光（IFA）和快速确认等方法。
HIV-1/2抗体是应用最多，且效果最好的感染筛选指标。相比于HIV抗原p24，尽管其窗口期更长，但不存在后期衰减。相比于HIV RNA，其成本更低，方法更多，更适合普及HIV感染筛选。
HIV抗原p24
应用：HIV感染筛选
测试方法：酶联免疫吸附测试、化学发光、免疫荧光、免疫层析试纸条、免疫渗滤法等测试方法。
HIV抗原p24无法单独应用于HIV感染筛选，但可结合HIV-1/2抗体进行早期感染筛选。其窗口期更短，是目前四代HIV试纸条的基础。
2 病毒学检测
HIV病毒分离
应用：HIV感染确认。
测试方法：外周血单核细胞（PBMC）共培养法。
阳性判定：培养上清液p24抗原或逆转录酶连续2次呈现阳性反应、并有p24抗原含量/逆转录酶活性升高，或同时出现HIV特异性细胞病变，并经鉴定为HIV基因序列，判为HIV-1分离阳性。
HIV病毒分离阳性是最直接的HIV感染确认方法。但该法检测技术要求较高，较难普及。同时分离阴性并不能排除HIV感染。
HIV核酸检测
应用：HIV感染筛查、HIV感染确认、婴儿HIV感染筛查、抗逆转录病毒治疗监控等。
HIV定性检测：实时定量PCR。
HIV定量检测：靶核酸扩增和信号放大。
定量结果判定：新行标规定，当检测值>5000 cps/mL报告阳性检测值；检测值＜5000cps/mL，需要再次采样检测，以确认检测值。最终结果需要结合临床及流行病史、CD4 淋巴细胞检测或者HIV-1抗体检测结果进行综合判断。
HIV核酸检测的窗口期更短，且是抗逆转录病毒治疗效果监控推荐的指标之一。尽管行标把核酸诊断纳入全民筛查方法，但较HIV-1/2抗体和HIV抗原p24，核酸检测技术难度和成本都也更高。HIV核酸检测是婴儿HIV感染最好的筛查指标。
3 细胞免疫学检测
CD4 淋巴细胞检测
应用：HIV感染检测、AIDS分期、抗逆转录病毒治疗监控等。
CD4 淋巴细胞计数：用于成人及5岁以上儿童和青少年。当计数结果≥500/mm³，则无缺陷。350-499/mm³，轻度缺陷。200-349/mm³，中度缺陷。＜200/mm³，重度免疫缺陷。
CD4 淋巴细胞百分比：用于5岁以下儿童。具体判定标准如下。
判定标准
检测技术：流式细胞仪或显微镜手动计数。
CD4 淋巴细胞检测是HIV感染和AIDS分期的判定标准。无法单独作为筛查的诊断标志物。
汇总表格如下
汇总表格
其它标志物：应用于HIV感染监控
1 基因分型检测
研究该技术的企业有雅培和西门子。基因分型系统适用于检测 HIV 基因组突变（这些突变赋予其对特定类型抗逆转录病毒药物的抗性），从而作为监测和治疗 HIV 感染的辅助手段。本质上这是一个技术集成系统，包括样品准备系统，反转录PCR系统，测序系统，毛细管电泳系统和报告系统。
2 干血斑测试
干血斑（Dry Blood Spots, DBS）目前用在新生儿HIV早期感染诊断与偏远落后地区HIV流行的监控。由于采血量少（50-80μL），采集制备成本低，制作简单，适合运输等特点，该方法在一些特殊场合有他的应用价值。
3 免疫类标志物
这些免疫因子尽管不属于HIV感染的特异性标志物，但可溶性白细胞介素-2受体，白细胞介素-6，血清IgA和血清细胞因子等的升高意味着HIV感染者的患病率会升高。
4 其它标志物
HIV感染后期与慢性炎症相关的许多生物标志物也会升高，这些疾病包括心血管疾病，多种形式的癌症，肝病，肾病，神经认知衰退和骨质疏松症等。白细胞介素-6，C-反应蛋白，D-二聚体这些都会在这个过程中出现异常。白细胞介素-6是一种细胞因子，目前也用作感染的生物标志物。C-反应蛋白是目前最常用的感染生物标志物之一。D-二聚体的升高证明了凝血酶正在生成，是血栓诊断常用的生物标志物。目前大量的研究证明，HIV感染会增加静脉血栓形成的风险。
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