—平成初期—
1994年 日本本土发射到火星的无人探测机被Evolt的一部分截获，并随着探测机来到地球，趁不备侵入了万丈龙我之母·万丈尤里的身体内。
但是因为各种原因，侵入体内的Evolt因子丧失了知性，成为了万丈尤里体内胎儿的一部分。
因为Evolt因子，仅仅过了两个月，万丈龙我便出生了。
—千禧年—
葛城忍通过研究万丈龙我，得出了“宇宙中有外星生命”的结论。
为了验证这个结论，2007年 宇航员石动惣一参加“极”火星探索计划，并在火星文明的遗迹内发现了潘多拉盒。沉睡于潘多拉盒的Evolt侵入了石动惣一的体内，获得了他身体的控制权。并利用石动惣一的记忆，生成了60瓶互相配对的满瓶。并且，残存的Blood族也侵入了其他宇航员的体内。四名宇宙外生命体便正式进入了地球...
同年
在“极”探索计划的发表会的场地（指草地）上，被Evolt附身的石动惣一潜入会场，与潘多拉盒发生接触，想要打开潘多拉盒。
但是因为发表会前夕，石动惣一之女·石动美空与残存于火星的另一个遗物·贝鲁纳姬产生反应，并将潘多拉盒内藏的60个满瓶的成分全部释放出，世界（指日本本土）并没有因为巨大的能量毁灭。但是潘多拉板块本身也有强大的力量，三块横跨日本国土的巨大魔墙将日本分割为三部分，并发射出耀眼的白光将参加发表会的人类的好战心激发出，这起事故又被称为“天空墙惨剧”受到白光影响的大臣·多治见喜子与御堂正邦，在分割的故土中宣扬分裂理论，最终导致了日本事实上的分裂，分裂后的日本变为东都·北都·西都三个国家，长久对峙了十年。
引发这一切的宇航员石动惣一在事发后昏迷并被关入病院，但在三个月后逃出并带走了同样昏迷的石动美空与潘多拉盒。
逃走的石动惣一通过各种渠道找到了研究万丈龙我的学者·葛城忍，并以力量与“新世界”威胁葛城忍修复EvolDriver。
葛城忍在修复EvolDriver与研究满瓶的过程中，得知了石动惣一的真实身份，并以EvolDriver与EvolTrigger为蓝本，开发出了RiderSystem与HazardTrigger，最后发现了就连Evolt也不知道的秘密——潘多拉的“白”之板块。
最后葛城忍以潘多拉“黑”之板块与人工的技术，设计出了十瓶LostBottle，并告知石动惣一“十瓶黑金色的LostBottle与黑板块结合之时，成为完全体的你将会获得新的进化”
在盒子开启前后，石动惣一与难波重工达成了合作关系，为制造Smash与Graudian创造环境，也使得难波重工的技术力突飞猛进，最终成为了控制国家的大型财团。
难波重工在“天空墙惨剧”发生后，开始有意识的对赞助的孤儿院的儿童进行洗脑教育与菁英教育，使其成为难波手下的人才与间谍，渗透于三都国家机关之中。
—新平成时代—
2014年，东都首相之子冰室幻德闻到北都与西都疯狂扩张军备的要求要求辅佐官·布袋幸司向首相求情，增强国内的军备，但被布袋幸司拒绝而无能狂怒。
葛城忍之子·葛城巧在东都先端物质研究所内担任研究员，并因为利用星云气体对人类进行人体试验而被所长·冰室幻德开除。
那之后，冰室幻德找到失业的葛城巧，请求他为“更进一步的研究”效力，葛城巧受不住诱惑，成为了冰室幻德地下研究所的研究员。葛城巧在地下工作的期间，以恩师·最上魁星的KaiserSystem与LostBottle为蓝本，开发出了Transteam Gun。
石动惣一作为难波重工的使者出现在冰室幻德的面前，冰室幻德虽对其抱有戒心，但并没有警惕。日后，石动惣一杀死了首相候补·布袋幸司，目睹了布袋幸司的死相的冰室幻德彻底扭曲，并宣布恶魔科学组织·浮士德正式成立。
在成立以后，冰室幻德被迅速架空，成为了低能政治家。
苏醒的石动美空在浮士德内，一直被用于净化满瓶，达成石动惣一的目的，但是在石动美空产生抵抗意识后，石动惣一开始酝酿新的阴谋
2015年，葛城巧阻止自己的老师·最上魁星启动平行世界融合装置【Eniguma】，抢在魁星前穿越到了《假面骑士Ex-Aid》的世界中，吸收掉假面骑士Ex-aid的力量防止Eniguma启动后没有底牌，并在找Ex-Aid的途中，顺便打掉了Genm一条命。
【Eniguma】启动前葛城巧与最上魁星开始斗殴，因为误操作使得最上魁星失去了半个身体，最上魁星对葛城巧彻底记恨。
2016年，葛城巧在父亲的研究资料中，制造出了RiderSystem与HazardTrigger，并通过改进，制作出了根本卖不出去的SclashSystem的一部分，后来因为对战争的顾忌中止开发。
并在父亲的研究资料中，得知了石动惣一的真正身份与EvolDriver的位置，将EvolDriver拆解并藏起来的葛城巧，在自己家中迎候Evolt——石动惣一的到来。
但是石动惣一早有准备，在来公寓前将葛城巧的BUILD DRIVER替换掉，并在同伴的协力下，请来了两位替死鬼。
一位就是被葛城忍指定为最后的希望的万丈龙我。一位是连烤肉都没吃上的佐藤太郎。交涉失败的葛城巧被变身为Stalk的石动惣一击晕，并顺便杀掉了不好好开门的佐藤太郎，最后将两人的脸调换后脱离现场。带着易容为佐藤太郎的葛城巧的石动惣一在公寓楼下的停车场报案，并目睹万丈龙我走入葛城家被捕的过程。石动惣一将葛城巧的记忆消除后，将其带到浮士德的某个实验室内，灌入大量的星云气体消除他的短期记忆。最后将葛城巧扔到路边。数分钟后，一名没有EvolDriver的网友路过，并收留到了一名失忆青年，桐生战兔，诞生。同年，石动惣一带着石动美空与潘多拉“绿”板块，从浮士德中消失了。
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