与许多其他国家不同，日本国内并没有严格意义上官方发布的本国大学排名。这主要是因为日本的大学分为国立大学和私立大学两类，日本国立大学偏重学术研究，日本私立大学偏重社会实践，两类学校有比较明显的风格差异，可比性不高。
依据国立大学排名及日本民间对各大学的印象大致分级，可分为S级到F级。其中，S级大学最好，是国际超一流大学；A级其次，是次国际一流大学；再往下是B类国内一流大学、C类国内次一流大学、D类国内二流大学，依次类推，超过600所大学被归为E、F级别大学。这样的分级结合了大学学术水平和就业水平后的一个综合认识，比较能反应日本人眼中大学的档次。
1S级大学-国际超一流大学
【S1】：东京大学
【S2】：京都大学
2A级大学-国际一流大学
【A1】：东京工业大学 一桥大学 庆应义塾大学
【A2】：大阪大学 东北大学 名古屋大学
【A3】：九州大学 北海道大学早稻田大学
3B级大学-国内一流大学
【B1】： 神户大学 东京外国语大学 筑波大学
【B2】：横滨国立大学 千叶大学 广岛大学 御茶水女子大学
【B3】：首都大学东京 东京学艺大学 大阪外国语大学（现为大阪大学外国语学部）大阪市立大学 上智大学 同志社大学
4C级大学-国内次一流大学
【C1】：金泽大学 冈山大学 熊本大学 电气通信大学 东京艺术大学大阪教育大学 京都工艺纤维大学 名古屋工业大学 东京理科大学明治大学青山学院大学关西学院大学立教大学
【C2】：埼玉大学 新泻大学 静冈大学 中央大学奈良女子大学 东京海洋大学 东京农工大学 九州工业大学 横滨市立大学 大阪府立大学 京都教育大学 名古屋市立大学 学习院大学 立命馆大学
【C3】：法政大学 关西大学 明治学院大学 专修大学 滋贺大学 信州大学 群马大学 茨城大学 京都府立大学小樽商科大学 南山大学成蹊大学
5D级大学-国内二流大学
东洋大学 驹泽大学 国士馆大学 东海大学 龙谷大学甲南大学武藏大学东京都市大学等
地方国公立大学、首都圈京阪神地区中日本地区各大中坚私立大学、专业性理工科大学等近50所大学
6E级大学-三流大学
不入流国公立大学、首都圈普通私立大学等近100所大学
7F级大学-四五流不入流大学
近500所各式各样私立大学
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