mysql 删除数据回收空间
浅谈为什么MySQL不建议delete删除数据目录
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前言
- InnoDB存储架构
- Innodb表空间
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Inndob存储分布
- 创建空表查看空间变化
- 插入数据后的空间变化
- delete数据后的空间变化
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Innodb中的碎片
- 碎片的产生
- 碎片的回收
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delete对SQL的影响
- 未删除前的SQL执行情况
- 删除后的SQL执行情况
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delete优化建议
- 控制业务账号权限
- delete改为标记删除
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数据归档方式
- 通用数据归档方法
- 优化后的归档方式
- 总结
前言
我负责的有几个系统随着业务量的增长,存储在MySQL中的数据日益剧增,我当时就想现在的业务方不讲武德,搞偷袭,趁我没反应过来把很多表,很快,很快啊都打到了亿级别,我大意了,没有闪,这就导致跟其Join的表的SQL变得很慢,对的应用接口的response time也变长了,影响了用户体验。
事后我找到业务方,我批评了他们跟他们说要讲武德,连忙跟我道歉,这个事情才就此作罢,走的时候我对他们说下次不要这样了,耗子尾汁,好好反思。
骂归骂,事情还是得解决,时候我分析原因发现,发现有些表的数据量增长很快,对应SQL扫描了很多无效数据,导致SQL慢了下来,通过确认之后,这些大表都是一些流水、记录、日志类型数据,只需要保留1到3个月,此时需要对表做数据清理实现瘦身,一般都会想到用insert + delete的方式去清理。
这篇文章我会从InnoDB存储空间分布,delete对性能的影响,以及优化建议方面解释为什么不建议delete删除数据。
InnoDB存储架构
从这张图可以看到,InnoDB存储结构主要包括两部分:逻辑存储结构和物理存储结构。
逻辑上是由表空间tablespace —> 段segment或者inode —> 区Extent ——>数据页Page构成,Innodb逻辑管理单位是segment,空间分配的最小单位是extent,每个segment都会从表空间FREE_PAGE中分配32个page,当这32个page不够用时,会按照以下原则进行扩展:如果当前小于1个extent,则扩展到1个extent;当表空间小于32MB时,每次扩展一个extent;表空间大于32MB,每次扩展4个extent。
物理上主要由系统用户数据文件,日志文件组成,数据文件主要存储MySQL字典数据和用户数据,日志文件记录的是data page的变更记录,用于MySQL Crash时的恢复。
Innodb表空间
InnoDB存储包括三类表空间:系统表空间,用户表空间,Undo表空间。
**系统表空间:**主要存储MySQL内部的数据字典数据,如information_schema下的数据。
**用户表空间:**当开启innodb_file_per_table=1时,数据表从系统表空间独立出来存储在以table_name.ibd命令的数据文件中,结构信息存储在table_name.frm文件中。
**Undo表空间:**存储Undo信息,如快照一致读和flashback都是利用undo信息。
从MySQL 8.0开始允许用户自定义表空间,具体语法如下:
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CREATE TABLESPACE tablespace_name ADD DATAFILE 'file_name' #数据文件名 USE LOGFILE GROUP logfile_group #自定义日志文件组,一般每组2个logfile。 [EXTENT_SIZE [=] extent_size] #区大小 [INITIAL_SIZE [=] initial_size] #初始化大小 [AUTOEXTEND_SIZE [=] autoextend_size] #自动扩宽尺寸 [MAX_SIZE [=] max_size] #单个文件最大 size ,最大是32G。 [NODEGROUP [=] nodegroup_id] #节点组 [WAIT] [COMMENT [=] comment_text] ENGINE [=] engine_name |
这样的好处是可以做到数据的冷热分离,分别用HDD和SSD来存储,既能实现数据的高效访问,又能节约成本,比如可以添加两块500G硬盘,经过创建卷组vg,划分逻辑卷lv,创建数据目录并mount相应的lv,假设划分的两个目录分别是/hot_data 和 /cold_data。
这样就可以将核心的业务表如用户表,订单表存储在高性能SSD盘上,一些日志,流水表存储在普通的HDD上,主要的操作步骤如下:
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#创建热数据表空间 create tablespace tbs_data_hot add datafile '/hot_data/tbs_data_hot01.dbf' max_size 20G; #创建核心业务表存储在热数据表空间 create table booking(id bigint not null primary key auto_increment, …… ) tablespace tbs_data_hot; #创建冷数据表空间 create tablespace tbs_data_cold add datafile '/hot_data/tbs_data_cold01.dbf' max_size 20G; #创建日志,流水,备份类的表存储在冷数据表空间 create table payment_log(id bigint not null primary key auto_increment, …… ) tablespace tbs_data_cold; #可以移动表到另一个表空间 alter table payment_log tablespace tbs_data_hot; |
Inndob存储分布
创建空表查看空间变化
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mysql> create table user (id bigint not null primary key auto_increment, -> name varchar (20) not null default '' comment '姓名' , -> age tinyint not null default 0 comment 'age' , -> gender char (1) not null default 'M' comment '性别' , -> phone varchar (16) not null default '' comment '手机号' , -> create_time datetime NOT NULL DEFAULT CURRENT_TIMESTAMP COMMENT '创建时间' , -> update_time datetime NOT NULL DEFAULT CURRENT_TIMESTAMP ON UPDATE CURRENT_TIMESTAMP COMMENT '修改时间' -> ) engine = InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8mb4 COMMENT '用户信息表' ; Query OK, 0 rows affected (0.26 sec) |
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# ls -lh user1.ibd -rw-r ----- 1 mysql mysql 96K Nov 6 12:48 user.ibd |
设置参数innodb_file_per_table=1时,创建表时会自动创建一个segment,同时分配一个extent,包含32个data page的来存储数据,这样创建的空表默认大小就是96KB,extent使用完之后会申请64个连接页,这样对于一些小表,或者undo segment,可以在开始时申请较少的空间,节省磁盘容量的开销。
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# python2 py_innodb_page_info.py -v /data2/mysql/test/user.ibd page offset 00000000, page type <File Space Header> page offset 00000001, page type <Insert Buffer Bitmap> page offset 00000002, page type <File Segment inode> page offset 00000003, page type <B-tree Node>, page level <0000> page offset 00000000, page type <Freshly Allocated Page> page offset 00000000, page type <Freshly Allocated Page> Total number of page: 6: #总共分配的页数 Freshly Allocated Page: 2 #可用的数据页 Insert Buffer Bitmap: 1 #插入缓冲页 File Space Header: 1 #文件空间头 B-tree Node: 1 #数据页 File Segment inode: 1 #文件端inonde,如果是在ibdata1.ibd上会有多个inode。 |
插入数据后的空间变化
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mysql> DELIMITER $$ mysql> CREATE PROCEDURE insert_user_data(num INTEGER ) -> BEGIN -> DECLARE v_i int unsigned DEFAULT 0; -> set autocommit= 0; -> WHILE v_i < num DO -> insert into user (` name `, age, gender, phone) values (CONCAT( 'lyn' ,v_i), mod(v_i,120), 'M' , CONCAT( '152' ,ROUND(RAND(1)*100000000))); -> SET v_i = v_i+1; -> END WHILE; -> commit ; -> END $$ Query OK, 0 rows affected (0.01 sec) mysql> DELIMITER ; #插入10w数据 mysql> call insert_user_data(100000); Query OK, 0 rows affected (6.69 sec) |
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# ls -lh user.ibd -rw-r----- 1 mysql mysql 14M Nov 6 10:58 /data2/mysql/test/user .ibd # python2 py_innodb_page_info.py -v /data2/mysql/test/user.ibd page offset 00000000, page type <File Space Header> page offset 00000001, page type <Insert Buffer Bitmap> page offset 00000002, page type <File Segment inode> page offset 00000003, page type <B-tree Node>, page level <0001> #增加了一个非叶子节点,树的高度从1变为2. ........................................................ page offset 00000000, page type <Freshly Allocated Page> Total number of page: 896: Freshly Allocated Page: 493 Insert Buffer Bitmap: 1 File Space Header: 1 B-tree Node: 400 File Segment inode: 1 |
delete数据后的空间变化
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mysql> select min (id), max (id), count (*) from user ; + ---------+---------+----------+ | min (id) | max (id) | count (*) | + ---------+---------+----------+ | 1 | 100000 | 100000 | + ---------+---------+----------+ 1 row in set (0.05 sec) #删除50000条数据,理论上空间应该从14MB变长7MB左右。 mysql> delete from user limit 50000; Query OK, 50000 rows affected (0.25 sec) #数据文件大小依然是14MB,没有缩小。 # ls -lh /data2/mysql/test/user1.ibd -rw-r ----- 1 mysql mysql 14M Nov 6 13:22 /data2/mysql/test/user.ibd #数据页没有被回收。 # python2 py_innodb_page_info.py -v /data2/mysql/test/ user .ibd page offset 00000000, page type <File Space Header> page offset 00000001, page type < Insert Buffer Bitmap> page offset 00000002, page type <File Segment inode> page offset 00000003, page type <B-tree Node>, page level <0001> ........................................................ page offset 00000000, page type <Freshly Allocated Page> Total number of page: 896: Freshly Allocated Page: 493 Insert Buffer Bitmap: 1 File Space Header: 1 B-tree Node: 400 File Segment inode: 1 #在MySQL内部是标记删除, |
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mysql> use information_schema; Database changed mysql> SELECT A. SPACE AS TBL_SPACEID, A.TABLE_ID, A. NAME AS TABLE_NAME, FILE_FORMAT, ROW_FORMAT, SPACE_TYPE, B.INDEX_ID , B. NAME AS INDEX_NAME, PAGE_NO, B.TYPE AS INDEX_TYPE FROM INNODB_SYS_TABLES A LEFT JOIN INNODB_SYS_INDEXES B ON A.TABLE_ID =B.TABLE_ID WHERE A. NAME = 'test/user1' ; + -------------+----------+------------+-------------+------------+------------+----------+------------+---------+------------+ | TBL_SPACEID | TABLE_ID | TABLE_NAME | FILE_FORMAT | ROW_FORMAT | SPACE_TYPE | INDEX_ID | INDEX_NAME | PAGE_NO | INDEX_TYPE | + -------------+----------+------------+-------------+------------+------------+----------+------------+---------+------------+ | 1283 | 1207 | test/ user | Barracuda | Dynamic | Single | 2236 | PRIMARY | 3 | 3 | + -------------+----------+------------+-------------+------------+------------+----------+------------+---------+------------+ 1 row in set (0.01 sec) PAGE_NO = 3 标识B-tree的root page是3号页,INDEX_TYPE = 3是聚集索引。 INDEX_TYPE取值如下: 0 = nonunique secondary index ; 1 = automatically generated clustered index (GEN_CLUST_INDEX); 2 = unique nonclustered index ; 3 = clustered index ; 32 = full -text index ; #收缩空间再后进行观察 |
MySQL内部不会真正删除空间,而且做标记删除,即将delflag:N修改为delflag:Y,commit之后会会被purge进入删除链表,如果下一次insert更大的记录,delete之后的空间不会被重用,如果插入的记录小于等于delete的记录空会被重用,这块内容可以通过知数堂的innblock工具进行分析。
Innodb中的碎片
碎片的产生
我们知道数据存储在文件系统上的,总是不能100%利用分配给它的物理空间,删除数据会在页面上留下一些”空洞”,或者随机写入(聚集索引非线性增加)会导致页分裂,页分裂导致页面的利用空间少于50%,另外对表进行增删改会引起对应的二级索引值的随机的增删改,也会导致索引结构中的数据页面上留下一些"空洞",虽然这些空洞有可能会被重复利用,但终究会导致部分物理空间未被使用,也就是碎片。
同时,即便是设置了填充因子为100%,Innodb也会主动留下page页面1/16的空间作为预留使用(An innodb_fill_factor setting of 100 leaves 1/16 of the space in clustered index pages free for future index growth)防止update带来的行溢出。
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mysql> select table_schema, -> table_name,ENGINE, -> round(DATA_LENGTH/1024/1024+ INDEX_LENGTH/1024/1024) total_mb,TABLE_ROWS, -> round(DATA_LENGTH/1024/1024) data_mb, round(INDEX_LENGTH/1024/1024) index_mb, round(DATA_FREE/1024/1024) free_mb, round(DATA_FREE/DATA_LENGTH*100,2) free_ratio -> from information_schema.TABLES where TABLE_SCHEMA= 'test' -> and TABLE_NAME= 'user' ; + --------------+------------+--------+----------+------------+---------+----------+---------+------------+ | table_schema | table_name | ENGINE | total_mb | TABLE_ROWS | data_mb | index_mb | free_mb | free_ratio | + --------------+------------+--------+----------+------------+---------+----------+---------+------------+ | test | user | InnoDB | 4 | 50000 | 4 | 0 | 6 | 149.42 | + --------------+------------+--------+----------+------------+---------+----------+---------+------------+ 1 row in set (0.00 sec) |
其中data_free是分配了未使用的字节数,并不能说明完全是碎片空间。
碎片的回收
对于InnoDB的表,可以通过以下命令来回收碎片,释放空间,这个是随机读IO操作,会比较耗时,也会阻塞表上正常的DML运行,同时需要占用额外更多的磁盘空间,对于RDS来说,可能会导致磁盘空间瞬间爆满,实例瞬间被锁定,应用无法做DML操作,所以禁止在线上环境去执行。
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#执行InnoDB的碎片回收 mysql> alter table user engine=InnoDB; Query OK, 0 rows affected (9.00 sec) Records: 0 Duplicates: 0 Warnings: 0 ##执行完之后,数据文件大小从14MB降低到10M。 # ls -lh /data2/mysql/test/user1.ibd -rw-r ----- 1 mysql mysql 10M Nov 6 16:18 /data2/mysql/test/user.ibd |
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mysql> select table_schema, table_name,ENGINE, round(DATA_LENGTH/1024/1024+ INDEX_LENGTH/1024/1024) total_mb,TABLE_ROWS, round(DATA_LENGTH/1024/1024) data_mb, round(INDEX_LENGTH/1024/1024) index_mb, round(DATA_FREE/1024/1024) free_mb, round(DATA_FREE/DATA_LENGTH*100,2) free_ratio from information_schema.TABLES where TABLE_SCHEMA= 'test' and TABLE_NAME= 'user' ; + --------------+------------+--------+----------+------------+---------+----------+---------+------------+ | table_schema | table_name | ENGINE | total_mb | TABLE_ROWS | data_mb | index_mb | free_mb | free_ratio | + --------------+------------+--------+----------+------------+---------+----------+---------+------------+ | test | user | InnoDB | 5 | 50000 | 5 | 0 | 2 | 44.29 | + --------------+------------+--------+----------+------------+---------+----------+---------+------------+ 1 row in set (0.00 sec) |
delete对SQL的影响
未删除前的SQL执行情况
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#插入100W数据 mysql> call insert_user_data(1000000); Query OK, 0 rows affected (35.99 sec) #添加相关索引 mysql> alter table user add index idx_name( name ), add index idx_phone(phone); Query OK, 0 rows affected (6.00 sec) Records: 0 Duplicates: 0 Warnings: 0 #表上索引统计信息 mysql> show index from user ; + -------+------------+-----------+--------------+-------------+-----------+-------------+----------+--------+------+------------+---------+---------------+ | Table | Non_unique | Key_name | Seq_in_index | Column_name | Collation | Cardinality | Sub_part | Packed | Null | Index_type | Comment | Index_comment | + -------+------------+-----------+--------------+-------------+-----------+-------------+----------+--------+------+------------+---------+---------------+ | user | 0 | 标签:
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