重庆经济技术开发区于1993年经国务院批准设立，是中国西部地区第一个设立的国家级经开区。说起重庆经开区的成立不得不提成立于1990年在南岸南坪地区面积仅1.5平方公里的“丹桂台商投资区”。1993年，“丹桂台商投资区”升级为重庆经开区，开发区范围也扩大到9.6平方公里，位于南岸区南坪区域，管委会设置在南坪万寿路。2001年，重庆经济技术开发区开始形成一区两园格局，南区5.0平方公里主要为南坪地区，北区（北部新区经开园）4.6平方公里，后设置83.7平方公里的拓展区（包含鸳鸯街道和礼嘉镇以及出口加工区）。
2007年底，重庆市委市政府决定将高新区北区（北部新区高新园）与经开区北区（北部新区经开园）含出口加工区一起合并到北部新区，2010年8月1日完成“三区合一”管理体制。
2010年8月，重庆市政府委托南岸区管理重庆经开区，委托九龙坡区管理重庆市高新区，同时重庆经开区拓展到南岸大茶园地区，规划总面积约60平方公里，重庆经开区管委会后也搬到茶园通江大道。2018年，中国智谷(重庆)科技园在重庆经开区挂牌成立，将依托重庆经开区产业基础聚力建设绿色发展示范区、内陆开放先行区、智能经济创新区、“三生三宜”品质城。同年，市委、市政府决定建设广阳岛片区长江经济带绿色发展示范，重庆经开区三分之二区域纳入规划范围。2019年4月，市委、市政府全面深化开发区管理体制机制改革，进一步对重庆经开区赋能增效，推动重庆经开区高质量、高效率发展，重庆经开区管辖范围进一步拓展至93.95平方公里，其中，55.55平方公里纳入广阳岛片区长江经济带绿色发展示范。
