西瓜授粉主要靠蜜蜂等昆虫传粉，由于设施栽培大量使用以及遇上不良气候条件（如花期高温、雨日多等），使昆虫活动受到限制，容易导致授粉不良，导致西瓜坐瓜困难，需通过人工辅助授粉，才能保证坐果。
一、坐瓜节位选择。一般早熟品种在主蔓第12～15节留瓜为好，也就是第2雌花；中晚熟品种在主蔓20-25节留瓜，一般为第2或第3朵雌花。在低温、肥料不足、光照较弱、植株长势较差的情况下，可适当推迟留瓜；反之，留瓜时间可提前。坐瓜节位的一般原则是：保护地栽培的西瓜，坐瓜节位可低些；春季露地栽培的，坐瓜节位应高些；夏季西瓜坐瓜节位可低些。早熟品种坐瓜节位低，晚熟品种坐瓜节位应高些。
二、人工辅助授粉最佳时间。晴好天气在上午8～10时是雌花柱头和雄花花粉生理活性最旺盛的时间，也是人工授粉的最佳时间。
三、人工辅助授粉完成时间。通常西瓜人工授粉时间以7天为宜，最长不超过10天。如果7～10天内授完粉，则坐果期集中，管理方便，采收期集中，并且果实大小均匀，产量也高。
四、人工辅助授粉具体技术。授粉时，轻轻托起雌花花柄，使其露出柱头，然后选择当日开放的雄花，连同花柄摘下，将花瓣外翻或摘掉，露出雄蕊，在雌花的柱头上轻轻涂抹，使花粉均匀地散落在柱头上，一般1朵雄花可授2～4朵雌花。
五、人工辅助授粉注意事项。如果西瓜开花期间阴雨天气多，影响正常的传粉，可在雨前提前1天给雌花和雄花戴纸帽)防止雨淋，授粉时取下纸帽，授粉后雌花仍戴上，3天后取下。开花授粉时遇有阵雨，雨后2小时进行授粉，授粉应在3小时内完成，授粉后3小时内无雨，则正常管理，若3小时内有小雨，就补授1次。
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