通常我们说的肾炎，是指慢性肾小球肾炎，与肾盂肾炎大为不同。肾炎的发病病位在肾脏皮质层的肾小球，肾盂肾炎发病病位在肾脏的肾盂。除了发病病位不同外，两者的病因病理也完全不同，现代医学认为肾炎是由免疫介导的炎症，属于免疫系统的疾病范畴，而肾盂肾炎则是由细菌等病原体感染导致的炎症，属于感染性疾病范畴。既然两者的病因病理不一样，那么治疗及预后也就不同，现代医学治疗肾炎通常用激素、免疫抑制剂等治疗，而肾盂肾炎则用敏感抗生素治疗。预后方面，总体上来说肾盂肾炎要好于肾炎。
肾盂肾炎分为急性肾盂肾炎和慢性肾盂肾炎，其中慢性肾盂肾炎的病因比较复杂、病情容易反复、病程迁延，除了应用敏感抗生素抗感染治疗外，还通常需要对其他病因进行治疗，比如治疗患者存在的泌尿系统解剖异常、结石、梗阻和反流等情况。需要注意的是，不管是急性肾盂肾炎还是慢性肾盂肾炎，都会对肾功能造成一定的影响，需要积极治疗。相对慢性肾炎来说，如果因为肾盂肾炎造成不可逆的肾功能损伤，就实在是“太可惜”。
除了抗生素治疗，中医药治疗肾盂肾炎优势也是很明显的，总的治疗原则一般是"利尿通淋”，对于有肾虚表现的需要补肾，有脾虚症状的要健脾等。
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