兔子眼睛的颜色一共有7种类型，棕色，琥珀色，蓝色，蓝灰色，粉色，红宝石色，大理石色。其中，棕色最普通，大理石色最稀有。
眼睛有颜色的部分是虹膜，虹膜上色素不同，眼睛的颜色就不同。兔眼的颜色是两种色素的结果。真黑素产生深棕色，而褐黑素产生浅棕色。这些色素颗粒的大小也会影响眼睛的颜色。那些颗粒较大的兔子会有深棕色的眼睛，而颗粒较小的兔子会有蓝色的眼睛。
棕色眼睛的基因在兔子身上占优势，因此，棕色是家养兔子最常见的眼睛颜色。琥珀色的眼睛在野兔身上很常见。蓝灰色眼睛比其他兔子的眼睛颜色要少见一些。蓝灰色眼睛的兔子有小的真黑素颗粒，但较大的褐黑素颗粒使眼睛呈灰色。虽然这种颜色比较少见，但它仍是一种自然色调。
粉红色眼睛的兔子很少见。粉红色的眼睛是一种基因突变的结果，这种突变将自然的棕色稀释成粉红色。
红宝石色的眼睛是白化病的结果，非常罕见，特别是在野生环境中，白化病的基因是隐性的。然而，由于这种颜色的眼睛受到欢迎，许多饲养者为了利润而繁殖它们。
另一种被称为虹膜异色症的遗传性疾病是大理石眼的原因，这种情况极为罕见。它将虹膜分成不同大小和颜色的几个部分，可以产生棕色、蓝色和蓝灰色的任意组合。每只眼睛都是独立的，将显示不同的图案。
