众所周知臭氧在各行各业有很多应用，其主要的作用分成了三个方面：
（1）杀菌消毒，主要的应用行业有空气环境消毒、物表消毒；水消毒；果蔬食品消毒；医疗用消毒等消杀行业。
（2）分解有机物，主要应用的行业有农残降解；除醛除苯；袪味除烟；污水处理环节；垃圾处理环节等环保行业。
（3）抗炎、抗感染，主要应用的行业是医疗器械；医药软膏等医疗行业。
上述三个方面的作用，主要是得益于臭氧的强氧化性，臭氧可对细菌、真菌、病毒、支原体、等病原微生物形成的持续的杀灭或分解作用力。其原理是：臭氧是一种强氧化剂，其分子极不稳定，能分解产生氧化能力极强的单原子氧(O)和羟基(OH)，是独有的融菌型制剂，可迅速融入细胞壁，破坏细菌、病毒等微生物的内部结构，对各种致病微生物有极强的杀灭作用。灭菌过程属生物化学氧化反应。其消杀作用主要是通过以下四种形式实现的：
（1）臭氧能氧化分解细菌内部葡萄糖所需的酶，使细菌灭活死亡；
（2）作用于细菌细胞内的核物质，如核酸中的嘌呤和嘧啶，破坏它们的细胞器和DNA、RNA，使细菌的新陈代谢受到破坏，导致细菌死亡；
（3）臭氧与细菌细胞壁脂类双链反应，透过细胞膜组织，侵入细胞内，作用于外膜的脂蛋白和内部的脂多糖，使细菌发生通透性畸变而溶解死亡；
（4）臭氧作用于病毒的衣体壳蛋白的多肽链，并使DNA/RNA受到损伤，破坏形成它的蛋白质。噬菌体被臭氧氧化后，其表皮被破碎成许多碎片，从中释放出许多核糖核酸，干扰其吸附到寄存体上。
在抗炎抗感染、止疼镇痛、氧化胆固醇、提高机体免疫力、向缺血组织供氧这几个方面。臭氧通过杀灭/分解有害有机物，在杀灭分解时的副产物为氧气。因臭氧分子结构是三个氧原子组成的特殊分子，所以非常不稳定，常温常压下，20 分钟后会自动还原为氧或氧气。所以，临床上应用的臭氧都是现用现制的，制成臭氧后，可以根据需要，溶解于灭菌水中、血液中、体液中、或者直接作用于组织，达到不同的治疗目的。
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