故事发生在不久的未来，环太平洋地区的海底出现了一道巨大的裂缝，原来这是外星生物入侵地球的传送门。从裂缝中出来了接二连三的怪兽破坏肆虐，人类为了消灭怪兽不得不用上核弹，好不容易将怪兽一个个消灭干净，但由于核弹对环境造成严重的污染，而且怪兽似乎总是打不完。因此人类发明了巨型机甲，通过人类神经系统来控制机甲来攻击怪兽，但机甲对神经负载实在过重，需要二人达到精神同感后才能共同驾驶。
在使用机甲的最初几年，人类在打败怪兽的战斗上频频得胜，于是渐渐掉以轻心，不过怪兽却越来越大，也变得越来越强。后来在2020年的一天，一只人类从所未见的至今最巨型的怪兽出现在沿海，这只怪兽的级别相当于三级，比起以前人类打败的那些怪兽不知强了多少倍。这时，主角罗利和哥哥收到上级命令，操纵起他们的机甲——危险流浪者，前去保卫沿海城市。
在寻找怪兽的途中，罗利发现海中有一艘民用船在等待救援，没有按照原本的指令并改变方向前往深海，击败怪兽并把船民们救了出来。以为杀死了怪兽的罗利放松了警惕，没想到怪兽忽然复活了，打穿了它们机甲的驾驶舱，并杀死了罗利的哥哥。只剩下一人的罗利和怪兽殊死一搏，才勉强杀死怪兽。没了哥哥在的罗利独自驾驶机甲，艰难的靠了岸。但从那以后罗利放弃了机甲战士的身份，隐姓埋名的在建筑工地工作。
不知不觉过了五年，罗利的将军前来找他并劝服他加入机甲部队，渴望保卫地球的罗利答应了将军的请求，并前来驻扎地——香港，并且结识到了将军的干女儿，是一名来自日本的麻子。麻子十分优秀而且渴望能够成为一名机甲驾驶员，但将军始终不同意，结果罗利意外选择麻子作为自己的储备副驾驶员。将军犹豫再三也只好允许她与罗利进行心灵同感测试，令人没想到的是，在测试的过程中麻子陷入回忆逐渐失去控制，在惊慌中无意启动武器模式，差点把基地给炸掉，好在指挥台及时切断电源，这才阻止了一场危险。
因为这件失控事件罗利二人遭到了搁置处理，很快不久之后突然发生紧急情况，原来是海底的传送门又出现了两只前所未有的四级怪兽。将军调用了一切机甲去保卫城市，但这些怪兽狡猾地针对机甲的弱点一一击破，并使用电磁脉冲瘫痪了机甲所有的电子装备，让人类机甲在它们面前无计可施。这下人类的机甲没有电能，根本无法击败怪兽，就在这时大家想到了罗利的危险流浪者，它是唯一的使用核能作为驱动的机甲，可以免受电磁脉冲的干扰。情急之下罗利和麻子这才被将军允许使用他们的机甲作战，二人前往香港城区和怪兽进行了两次激烈的战斗，才击败怪兽。
虽然他们获得了胜利，然而将军是个未雨绸缪的人，他认为接下来出现的怪兽无疑越来越强大，唯一的解决办法就是将海底的传送门彻底核爆，只有这样才能彻底阻止怪兽的再次侵入。
就在将军动员机甲驾驶员们使用仅剩的两台机甲去把传送门核爆时，由于之前的驾驶员因为负伤无法再进行驾驶。将军决定亲自操纵机甲，尽管他之前有过遭受辐射的经历，再次驾乘机甲会有生命危险。但将军为了保卫城市还是和罗利各操纵一台机甲向海底出发了，在那里他们遭遇了大量的四级怪兽以及一只新进化的五级怪兽。
为了掩护罗利的将军决定启动自爆系统，以生命代价终于杀死了全部的四级怪兽，也让那只五级怪兽受到了一定的冲击。然而罗利的危险流浪者同样残破不堪，二人拼尽全力动用机甲的所有动力启动推进装置，将五级怪兽推下去，成功让它坠入了传送门，随后在坠落的过程中罗利启动了机甲胸前的火线喷射装置，这才杀死怪兽。但不幸的是，机甲也随怪兽的坠入了怪兽星球，急中生智的罗利启动自爆装置，自己和麻子则通过救生舱弹射回到地球的海面。
一分钟后，核爆终于斩断了怪兽星球和地球的连接。罗利和麻子漂浮在海面的救生舱上，碧海蓝天下紧紧的拥抱在一起。
可以说，本片最大的亮点就是华丽震撼的画面绝对是这电影的最大亮点，而且打斗场面也十分流畅，也不会有空洞堆砌而以致炫耀特技的感觉。除了后半部分剧情显得有点仓促，在情感部分也是一笔带过。信任就是主导整部电影的主旋律，不管是是机甲战士驾驶者间的心灵通感，还是将军在关键时刻最后动员的那些情节，其实只有彼此信任，才能让对方走进自己的内心，两人才能有行动上的默契，并且放下一切隔阂，共同面对未来，呈现出了信任的力量。
其实，从别的角度来看，也有点灾难片的成分，我们目睹了一幕幕人类的劳动成果在弹指间化为废墟，更难受的是一个个鲜活的生命在怪兽面前是如此脆弱，好在这片子里的人们面对灾难，是有团结一致，并且抛开一切只为保卫地球。灾难让人类回归到了真善美，其实有些牺牲真的是值得，因为我们能看到真正的自己，看到为使命感而活的自己。
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