1985年夏，一艘由四名日本人和二名美国人组成的走私船从菲律宾出发，准备去往非洲大陆。为了躲避搜查，走私头目美国人罗伯特，选择了一条偏僻的航线。在进入素有“东方百慕大”之称的太平洋深水海域时，遇上风暴，为了避风，他们停靠在一个荒无人烟的孤岛上。
大海、孤岛、船
这个岛有1O平方公里，人迹罕见，却处处草木苍翠、野果遍地，犹如一个世外桃源。然而想不到是，岛上有许多硕大如猫的巨鼠，正虎视眈眈，等着他们。
美丽的孤岛和巨鼠
他们一登上岛，就遭到巨鼠突如其来的攻击，先后有五人身体被巨鼠撕咬的露出白骨，倒在血泊中死去，只有一个名叫洛比的人，依靠手中的喷火枪，打退愈来愈多巨鼠的围攻，退回到船上逃走。
人和巨鼠大战
10年以后，幸存者洛比把这件人鼠大战、恐怖、悲惨的遭遇，告诉给了一名传奇探险家巴德。巴德决定上巨鼠岛一探究竟。
巴德精明老练，组建了探险船队，为了安全保险，他还租用一辆装备精良的军用水陆两栖装甲车。在看了洛比提供的航海草图及孤岛的大至方位后，便立即出发。
巴德的船队很快便找到了那座孤岛。他们先驾船环岛观察一番，选中了一块可攻可守的滩地作为登陆地点。
当他们驾着装甲车登上荒岛的一瞬间，就被巨鼠紧紧包围，它们怪叫着，瞪着血红的眼睛逼上来。巴德见状急令手下用机枪猛烈扫射，装甲车也把许多巨鼠压得粉身碎骨，巴德他们还动用了先进的喷火枪，烧死了大片巨鼠。然而巨鼠越聚越多，数只巨鼠还爬上装甲车，用锋利的毒牙啃得装甲车和防弹玻璃“咯咯”响。巴德他们迫不得已，决定施放毒气，凶残的巨鼠纷纷毙命。
装甲车大战巨鼠
岛上的老鼠为何如此硕大、凶残无比？巴德他们终于在岛中心的一个山洞里找到答案。在炸开这个被人为封死的山洞入口后，他们在洞中发现了遍地的器械、器皿、导管、玻璃瓶子、口罩和皮手套等物品，在洞深处一张石凳上找到了一本精致的记事簿，这才揭开了这个不解之迷。
生化实验
原来二战期间，日本人选中了这座狐岛进行化学毒品试验，他们运来大量老鼠并把一种特制毒液注入它们体内，目的是测定毒品的威力。结果恰得其反，老鼠并未被毒杀，反而变得硕大凶残，成了吃人巨鼠。日本战败后，巨鼠愈来愈多，最终成了岛上的统治者。
老鼠注射病毒
注射病毒后变大的老鼠
最后，巴德感慨地说：二战日本人留下的毒品试验场，使误闯巨鼠岛的四名日本人和两名美国人，成了化学毒品间接试验的牺牲品，这不是偶然的一件事，而是必然会在他们身上发生的结果。
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