指纹鉴定，百年以来作为一门侦查技术，在打击犯罪保护人权方面起了巨大的作用，但它并不是完美无缺的，一系列的事实表明，在具体运用的时候，指纹鉴定受到了各种主客观条件限制，稍有不慎，就有可能出现差错。
众所周知，人的指纹在胚胎发育后两个月就形成，人各有异(一般一个手指头上就有140一200个特征点)，终生不变，触物留痕。因此，通过指纹可以认定罪犯，指纹故而被称为“物证之首!”早先的指纹鉴定，主要凭靠经验判断一一罪犯只要在现场留下明显的手印，那就难逃指纹鉴定专家的火眼金睛。但是，随着社会的发展，现代犯罪出现了“智能化"的趋势：案犯或是在作案后清除现场痕迹;或是选择人多杂乱的环境作案，使他自己的手印无数次地被重复迭压而难以显现。有时，现场被无意破坏，难以发现罪犯的明显痕迹。这一切都给案件侦破带来了很大的困难。
然而，现代科学技术给传统的刑事技术注入了新的活力，技术人员可用先 进的仪器设备和技术对现场提取的痕迹进行显现。所以，现在对于疑难指纹鉴定，程序是这样的：首先，技术人员对检材进行“无损检验"，即用各种光源一一自然光源、多波段光源、激光、长短波紫外光源等一一照射检材，利用不同颜色物质对光的吸收、反射率不同的现象，分辨出不同的手印;在“无损检验”无效的情况下，根据检材材料的化学特点，采取不同的物理化学检验方法，如“502”加湿熏显法、“DFO”显现法等;最后，用放大镜将显现手印与嫌疑人手印进行对比，作出科学鉴定。
在以认真负责的态度对待指纹鉴定的情况下，笔者认为指纹鉴定仍是刑事侦查中可依赖的技术之一。
首先，指纹鉴定人员要有敬业精神、工作认真细致，不能敷衍塞责。要做到这一点，仅期望于鉴定人的良心是不可靠的，因此就需要引入最关键的一点：这就是需要赋予被告人制约鉴定人的权利，防止其滥用鉴定权。
其次，应树立质证意识，杜绝仅凭指纹鉴定这一孤证来认定犯罪，确立刑诉法确立的任何证据都要查证属实的证据意识，只有在证据之间形成完整的证据锁链、排除合理怀疑的情况下才能据以定案。
最后，在实践中牢固树立真理的相对性原则。鉴定结论的科学性是相对的，并不是毋庸置疑的绝对真理，它的科学性既受到鉴定人的技术水平、敬业精神等主观因素的制约，也受到验材、仪器等客观条件的限制，而在司法实践中因鉴定结论错误导致的错案并不鲜见。
我国《刑事诉讼法》第121条规定：侦查机关应当将用作证据的鉴定结论告知犯罪嫌疑人、被害人。如果犯罪嫌疑人、被害人提出申请，可以补充鉴定或者重新鉴定。这一规定充分体现了以当事人权利制约鉴定人的精神，对保证案件质量有着重要的意义，但该规定在实践中并没有得到很好的实施。
不告知的原因往往是：一、以侦查工作需要保密为借口，而不告知;二、怕重复鉴定，增加费用支出;三、验材消失，使得重新鉴定成为不可能，同时也就失去了告知的意义(比如凶杀案件中，一经鉴定即将尸体火化，使得复检没了可能)。归根到底，不告知案件当事人重新或补充鉴定的权利，骨子里还是迷信鉴定结论的科学性，认为不需要告知，从而使有关当事人失去了对错误鉴定要求复核的救济权利。
指纹的捺印其一应使用专用的印泥或印油，防止印泥或印油在手指上堆积，形成捺印指纹的模糊和不清晰。印泥和印油为红色、兰色、黑色均可。其二是捺印指纹的顺序是以右手的食指、拇指、中指为依次顺序的，如果右手手指因特殊情况，指纹捺印不能满足要求时，可用左手的食指、拇指、中指依次代替，最好在指纹捺印中 注明。其三在捺印过程中是将手指平放在要捺印的有关材料或文件上，从左至右用手指滚动捺印，捺印的力大小要掌握火候，这样指纹的纹路会清晰地留在材料或文件上，最好在捺印前确认印泥或印油在手指上遗留的程度。也可请专业人员或有这方面知识的人操作。
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