公务员单位是指行政机关或者党群机关，在许多人的心目中，公务员都比事业单位强，这是社会共识，虽然个人认为没有什么更强的地方。有两个非常直观的证明，支撑着这个共识：一个是公务员单位是主管部门，管理事业单位；另一个是每年的国考、省考，从大学毕业生中招考公务人员，首先考的是公务员，其次才是各省招考的事业人员，换句话说，是先由公务员单位挑选完了之后，才由事业单位挑选。
行政机关和事业单位，有着本质的区别，在管理模式、编制类型、人员身份、职能职责、工资待遇同、社会地位、前途发展和改革方向等方面，都有着严格的区别：
1、机构、编制、职能性质不同，人事管理和财政供养方式不同：公务员单位是行政部门和党群机关，是领导机构和主管部门，是代替政府和党委行使权力的职能部门。政府权力是法律法规赋予的，由机构编制部门根据法律规定为依据进行职能、机构、编制划分，代替政府行使权力。行政部门由《公务员法》规范管理，使用的是行政编制，是公务员身份，由财政全额供给。
2、社会地位不同：行政机关是主管部门，是承担具体行政职能的部门。事业单位除个别是政府直属外，其他都分别是各行政主管部门下属的事业单位，承担主管部门职能范围内的具体业务和公共服务事项，受行政主管部门直接管辖，其考核以行政主管部门为主。事业单位行政级别低于行政主管部门级别，最多持平。
3、工资福利待遇不同：公务员执行的是职级工资，按照科员、科级、处级等15级级别，对应不同的工资福利待遇。事业单位人员除按照公务员职级待遇管理外，还有专业技术职称工资待遇，其中管理岗位分为十级，对应不同的行政级别；专业技术岗位13级，工勤岗位5级。目前，行政与事业单位养老并轨，除公务员公车改革结束，可以享受公车补贴外，在工资福利方面与事业单位总体水平没有什么大的区别。在本地，是专业技术人员平均待遇好过公务员，公务员好过普通事业人员。
4、改革方向不同。行政主管部门除部分职能随社会发展变化，出现弱化或者加强，需要调整外，其他行政职能基本保持不变。行政机构改革，职能分分合合，但政府整体行政职能基本稳定，大盘子不变。
事业单位根据其公益服务属性的不同，其改革方向不同。行政类除行政执法继续保留外，其他全部按照职能划归行政部门，不再审批行政职能的事业单位。公益服务类事业单位，强调公益属性，可以由社会服务或者市场代替的，包括生产经营类事业单位，全部改制为企业，推向社会和市场，由政府购买服务代替。
整体来看，行政主管部门呈稳定趋势，事业单位不断改革，机构、编制、人员不断缩减，除不能或者不宜由社会或者市场承担的公益服务职能外，其它全部逐步推向社会和市场。
