活性炭可以吸附培养基中的有害物质，包括琼脂中所含的杂质，外植体在培养过程中分泌的酚、醌类等对外植体自身有害的物质。但活性炭同时又能吸附生长调节物质、维生素B6、叶酸和烟酸等有益物质。因此，对不同培养物不同阶段的培养，要做具体试验来确定其用量。
一、防止褐变，促进芽的增值
在茎尖培养和茎段培养时，为防止褐变和有害物质的积累，常在培养基中加入适量活性炭。汤浩等研究表明，果蔗茎尖培养时培养基中加人0.05%的活性炭对防止培养基褐变有良好的效果，有利芽的诱导和增殖。
二、创造黑暗环境，利于生根培养基
活性炭最广泛的应用是用于培养物的生根。一般认为活性炭创造的黑暗环境有利于根的诱导和根系的生长。由于根顶端产生的促进根生长的IAA易受可见光氧化而被破坏，而活性炭的主要作用是通过减弱光照保护IAA，从而间接促进了根的生长。由于根的生长加快，吸收能力增强，便促进了茎、叶的生长。
三、用于胚培养，促进成苗
在许多植物的胚培养时，也用到了活性炭。甜柿含酚类物质较多，组培时褐变严重，从而增加了胚培养的难度，需添加抗氧化剂，培养基中加入0.1%活性炭可减轻组织褐变和培养基变色，并产生较少愈伤组织，而不加活性炭则会导致组织褐变，并因产生愈伤组织过多而最终死亡。
四、用于花药培养
花药培养的主要目的是诱导花粉发育成单倍体，可以快速地获得纯系，缩短育种周期。花药培养时，培养基中加入活性炭对提高诱导频率有一定效果。目前，已在多种植物的花药培养中得到应用。另外，在培养基中加入适量的活性炭，可降低玻璃苗的产生频率，对防止产生玻璃苗有良好作用。
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