清嘉庆、光绪两部《崇庆州志·沿革》皆明确记述：“崇庆州，古蜀国也。”常载《华阳国志》记载：“后有王曰杜宇，教民务农，一号杜主。时朱提有梁氏女利游江原，宇悦之，纳以为妃。移治郫邑。”今天的崇州市域，即为文中所说的“江原”地区。
常璩《华阳国志》谓：“江原县，郡西，渡大江，滨文井江，去郡一百二十里”。郡指置于秦时的蜀郡，即今之成都市区；大江指金马河，文井江指今西河（元通以上今仍称文井江）。西晋时的120里折合为今之41.5公里，与今崇州市城区至成都少城（蜀郡治所）距离正合。这是秦汉江原县置于今崇州市城区最早最权威最准确的依据。《大元一统志》：“古州城，在崇庆州”，《明史》：“崇庆州，元治晋原县”，《隋志》：“晋原县，旧曰江原”，唐《元和志》：“晋原县，本汉江原县”，晋常译《华阳国志》：“江原县，郡西，渡大江，滨文井江”。今崇州市城区即元、明、清时的崇庆州城。由此可知，秦汉时所置的江原县治所就在今天的市府驻地崇阳镇城区，历史沿革，一脉相承。
东晋十六国时期，成汉于晋怀帝永嘉六年（312年）在江原县置汉原郡，改江原县为汉原县。汉原郡辖汉原、临邛二县。晋穆帝永和三年（347年），成汉为东晋所灭，东晋改汉原郡为晋原郡，复改汉原县为江原县。至南朝刘宋时（420—479年），晋原郡共辖5县：江原、临邛、晋乐、徙阳、汉嘉。除江原外，余皆侨县。萧齐（479—502年）改晋原郡为晋康郡，萧梁（502—554年）易名江原郡，仅辖江原、临邛（侨置）、晋乐（侨置）3县。西魏（535—557年）于今江源镇境域内侨置犍为郡及通道县。废江原郡、县，新置多融县，与通道县并隶犍为郡。北周（557—581年）将新置不久的多融县改为晋原县，直隶蜀郡。隋初，犍为郡及僰道县先后废侨，今崇州市境仅存一晋原县。晋原县历隋、唐、五代、宋、元，于明洪武初省入崇庆州，历时800多年。其治所在今崇阳镇西南龙门街古城。唐垂拱二年（686年），于晋原县地置蜀州。因此地为古蜀国，故名。天宝元年（742年）改唐安郡，乾元元年（758年）复改蜀州。至南宋绍兴十四年（1144年）升州为军时止，蜀州历时458年。蜀州共辖五县：晋原、唐隆[唐武德元年（618年）置于通道县侨址，先后改武隆、唐安、唐兴，五代后梁、后晋先后遥改陶胡、乡城，北宋开宝四年（971年）改江源、青城、新津、永康[后蜀广政十六年（951年）置，治所在津市境内街子镇。除青城、新津外，其余3县皆在津市境内。
南宋高宗皇帝赵构曾于大观元年（1107年）封于蜀州为蜀国公。绍兴十四年（1144年），因高宗“潜藩”（皇帝即位前的封地），升蜀州为崇庆军，以示崇敬庆祝之意。崇州历史上整整850年的“崇庆”之名即自此始。淳熙四年（1177年）升军为府，德佑元年，也即元至元十二年（1275年）升为总管府。共辖4县：晋原、江源、永康、新津。除新津外，前3县皆在津市境内。元至元二十年（1283年）降崇庆总管府为州，崇州自此称为崇庆州。曾管辖晋原、江源、永康、新津等县，前3县皆在今市境内。清雍正五年（1727年），崇庆成为不领县的散州，直至民国2年（1913年）废州改县，崇庆州共历时630年。 民国2年（1913年），民国政府废除清朝设置的府、州、厅，将崇庆州改为崇庆县，先后隶川西道、西川道、第一行政督察区。1949年中华人民共和国成立后继称崇庆县，先后隶温江专区（地区）、成都市。至1994年撤县设市时止，历时81年的“崇庆县”之称成为历史。为加速现代化建设，发挥地理和自然资源优势，促进改革开放和经济社会发展，崇庆县人民政府从1992年开始向成都市人民政府呈送关于撤县设市的请示报告。1994年6月10日，中华人民共和国民政部批复：“经国务院批准，同意撤销崇庆县，设立崇州市（县级），以原崇庆县的行政区域为崇州市的行政区域。”同年9月23日，全市隆重举行崇州市设立庆祝大会。新设立的崇州市由四川省直辖，省政府委托成都市代管，原有的一切关系不变。按照国务院地名管理条例规定，因为“崇庆”与“重庆”同音，不能将“崇庆县”更名为“崇庆市”。新市名既保留原崇庆之“崇”，又照顾到历史上长期设州的沿革，故定名“崇州市”。
