小叶紫檀树传输水分和营养的传输通道的横切面，即树干内导管横切面所形成的孔眼，就是小叶紫檀的棕眼，小叶紫檀棕眼是紫檀共有的特征。
人们经常习惯性的通过小叶紫檀手串棕眼的多少来判断小叶紫檀的品质，其实这是不正确，小叶紫檀手串的品质跟棕眼的多少关系不大，小叶紫檀的品质更多是跟小叶紫檀棕眼的大小和油性问题关系比较大。通常品质好的小叶紫檀，应是密度大，棕眼细而小，油性丰富。棕眼细小的小叶紫檀，棕眼的数量会比较多，因为棕眼通常是人们所说的树木的导管，导管细小的树木，密实，导管的数量也会比较多，这样会更好的用来传输水分和营养物质，只不过小叶紫檀在制作成工艺品的过程中因为一些工艺过程，盘完包浆，再加上棕眼的细小等，使得棕眼的数量变得不明显，这也是为什么一些料质好的小叶紫檀看起来棕眼数量较少，但其实它的棕眼数量并没有变。
那为什么有些小叶紫檀手串的棕眼会越盘越多呢，其实小叶紫檀手串的棕眼数量应该是不变的，越来越多只不过是之前不明显的小叶紫檀棕眼变明显了，或者越来越少是之前明显的棕眼变的不明显了。比如手串的打磨抛光过程中，有的是用蜂蜡，有的是用含蜡质的棉布再用转机抛，会在珠子表面会覆盖一层蜡质，使得棕眼空起初没那么明显，只不过是在盘玩过程中，大力搓或者粗糙的搓澡巾盘玩，破坏了表面的蜡质后，使得棕眼孔更加明显了。相反，盘玩过程后形成的包浆膜，再加上颜色的变深，会使人觉得棕眼数量变少了。
因此，小叶紫檀棕眼是小叶紫檀特有的特征，小叶紫檀的品质和棕眼数量的多少关系不大，跟小叶紫檀棕眼的大小和油性问题关系比较大。所以无需担心小叶紫檀棕眼变多了还是变少了。
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