《明史》卷二百八十四《儒林传·曾质粹》载，明成化初年事，“山东守臣上言，嘉祥县南武山西南，元寨山之东麓，有渔者陷入穴中，得悬棺，碣曰‘曾参之墓’。”大明朝成化年间，山东嘉祥县考古重大发现，当地官员具奏上疏朝廷，说有个渔民在本乡南武山掉进一个塌陷洞穴，其中有悬棺及墓碑，赫然写着“曾参之墓”，认为儒家四圣之一的曾子墓现世，是天下太平兴旺的吉兆。
当时的皇帝明宪宗朱见深，他收到官员的奏报后大喜，当即作为年度重大考古发现，下旨“封树丘陵，筑建飨堂神路”，要求嘉祥县地方好好保护先贤的墓葬。按照上级指示精神，嘉祥县大兴土木对曾子墓修缮保护，并仿照三孔的格局，在遗址上增建了府、庙、墓等纪念和祭祀建筑。
到了嘉靖时代，明世宗朱厚熜颁布明诏，在民间寻访曾子后裔给予赏赐，各级官员尽力寻找，终于在江西吉安永丰县境内找到了曾子的第五十九世孙曾质粹。嘉靖十二年（1533），在吏部侍郎顾鼎臣的奏请下，曾质粹一家得以东归嘉祥，回到祖先故里居住。至嘉靖十八年（1539），朝廷授曾质粹翰林院五经博士一职，子孙世袭。明嘉靖三十九年（1560）二月十六日，这位老先生以69岁高龄辞世。
有了曾子府、庙、墓，又有官方认可的曾氏后人，似乎山东嘉祥县成为曾子故里是板上钉钉的事实。修建三曾的消息传到费县，当地舆论哗然，费县知县、县丞等地方官员不能接受这个结论，他们认为“历代有关史志均明确记载曾子故里春秋鲁武城在费县境”，曾子为费县南武城人（今山东平邑县魏庄乡南武城），从未说过是嘉祥人。
费县地方官为此多次上书山东巡抚及三司衙门（都指挥司、布政司、按察司），要求上级单位主持公道，取消嘉祥县的举动，为自己正名。然而嘉祥县先人一步，取得了皇帝手谕批准，等于国家级认可，谁也不敢擅自推翻结论，由此开始了长达百年的“明清曾子故里之争”。
曾子无疑是孔夫子最得意的弟子之一，临终甚至托孤于他，历代诸多敬奉尊为“宗圣”。据《史记·仲尼弟子列传》载，曾子故里在南武城，同时提到澹台灭明是武城人。关于曾子故里本应非常明确的结论，问题却也出在这里。
南武城究竟在哪里，它与武城是不是一个地方？
按照《史记·仲尼弟子列传》的说法，“曾参，南武城人，字子舆，少孔子四十六岁。……澹台灭明，武城人，字子羽。少孔子三十九岁。”这里同时提到了孔子的两位弟子，并分别记述其故里，曾子是南武城人，澹台灭明是武城人。
根据唐代魏王李泰编纂的《括地志》、以及清代官修的《一统志》、学者顾祖禹所著《读史方舆纪要》等文献，山东确有两处被称作武城的地方，分别是“费之南武城”和“嘉祥武城”。
武城究竟在何处，根据《春秋》与《左传》记载，确有两个武城，均属鲁国所辖，一是在鲁境向南通往吴、邾的路上，另一在鲁境向北通往齐国的路上。从地理位置上讲，费县之武城在南，嘉祥之武城在北。
嘉祥县之南武城明代学者吕兆祥所著《宗圣志·世家志·宗圣邑里》考证，“武城，鲁下邑也，……宗圣家于此南武城，今嘉祥县南四十五里遂山社是也，有宗圣墓在焉。”认为武城是鲁国的下邑（小的城邑），明代属于嘉祥县，县下设社、屯为基本行政单元，万历二十三年（1595）设置遂山社（据县城南22.5公里，即四十五里），有宗圣墓遗址存在。
嘉祥县自古被称为麒麟的发祥地，而麒麟作为瑞兽，又与孔子有莫大关联，《左传》有“鲁西狩获麟”的记载，此地遂称“嘉祥”，取其嘉美祥瑞之意。吕兆祥进一步考证说，“武城，古兖州之域”，“金大定末，置嘉祥县，属济州”，“明兴，改属济宁州，武城即嘉祥所统之地”。说武城属于古九州之兖州，鲁国为了防御北边的齐国设置，因此称为“武城”，大金时设嘉祥县，明代以后属济宁府嘉祥县管辖。
为何嘉祥县境内的武城在北，却称作南武城呢？根据吕兆祥所记，这个武城，是为了御齐所修筑，在泰山之西南方，因嘉祥县境内的南武山而得名，所以叫“南武城”。
持同样观点的，还有清代学者顾栋高，他在《春秋大事表·列国地名考异》写道，“费县乃鲁与邾、吴相接界，非所当备齐处。襄十九年之武城宜在嘉祥。”
费县之武城按上述史籍记载，春秋战国时期鲁国只有一个武城（南武城是鲁国为抵御齐国后来设置），即费县之武城。
据史载，西周时属邾国地界，春秋为鲁国大夫季平子的食邑。据《左传·昭公二十三年》载，“邾人城翼，还，将自离姑。公孙鉏曰：‘鲁将御我’，欲自武城还，循山而南。”昭公二十三年，邾国派人修筑翼城后自西归，途经离姑，遭遇武城鲁兵袭击。史料所记之翼城，故城在今费县石井乡，离姑城在今平邑县魏庄乡，而鲁人发动攻击的武城故城在此二城附近，即鲁国南境通向吴、邾的费县武城，而嘉祥南武城据此百里之遥，显然不是。
从地名演变来看，春秋时为鲁国城邑的费县武城，战国时改属齐国，汉以后已无武城改为南城，才有南武城县之名，西晋属泰山郡，已称南城县没有“武”字，至唐以后属沂州改费县之名。可见费县并无“南武城”之名，彼时只有武城。
史籍为何将费县武城称作“南武城”，据《地理志》记载“定襄有西武城，清河有东武城，故云南武城”，为了与其他武城区别开。《齐乘》记载“古武城，费西、滕东两县之间，子游弦歌旧邑。”“费西、滕东两县之间”这个武城，就是孔门弟子子游的从政之地。
言偃曾经在费县武城做过行政长官，费县的武城与南方的邾、吴相接界，言偃恰好是孔门弟子中唯一的南方人。因为费县武城是孔子的另外一个弟子澹台灭明的故里，据《论语·雍也》记载，他孔子问他那里有没有人才，言偃就向老师推荐了澹台灭明。
费县、嘉祥曾子故里之争的结局清人赵祐在《四书温故录》明白提出，《史记》中所说武城，在曾子的故里添加以“南”字，即证明南武城与武城是截然不同的两地。古代武城在山东平邑，是澹台灭明之故里。而古代南武城，在山东嘉祥，是曾子之故里。可知，山东确有两处武城，曾子在南武城，澹台灭明在武城，这是两个不同地方，所以分别记述。
关于嘉祥县上呈的“曾子故里”申报，费县地方始终不予承认，只是碍于朝廷对曾子后裔“照孟、颜二氏例，授翰林五经博士”之议，不敢太过于争辩，却提出种种辩解，一是认为悬棺葬是川蜀地区的葬仪，山东当地从无此葬法，其二墓碑是西汉以后才出现的，公认最早的墓碣是在平邑县城出土的西汉河平三年（前26）麃孝禹碑，曾子是春秋战国时期人，此时中国尚未出现墓葬碑碣。
面对嘉祥县的“公然造假”，费县地方于明天启四年（1624），在武城东八里之关阳镇，将“子游祠”改建“二贤祠”，主祀曾子、言子，并附祀澹台子，至清代乾隆三十一年，“二贤祠”增扩，将澹台并列为“三贤”。后于乾隆四十三年，礼部代表朝廷批复山东巡抚国泰，准予仿照孔府建制，在南武城曾氏父子墓各设奉祀生1名，先后由曾子之七十、七十一、七十二代孙袭任。
清嘉庆十三年，山东督粮道孙星衍、费县知县郭志清等官员，于费县南武城设立曾点（曾参之父）墓碑一座。由此，费县曾子故里终于得到了清代政府的官方认可，持续了百年的争执告一段落。
