银离子抗菌的机理主要有两种：一是接触杀菌，二是催化杀菌。
接触杀菌是指银离子与细胞接触发生反应，造成细菌固有成分被破坏或产生功能障碍，导致细菌死亡，无法生长繁殖。
这主要是因为微生物的细胞膜大多数带有负电荷，银离子带正电荷，能够依靠静电吸引力牢固吸附在细胞膜上，并且能够进一步穿透细胞壁进入细菌细胞膜内，并与细菌中的巯基反应，导致细菌的蛋白质凝固，破坏细菌的细胞和成酶的活性，使细胞丧失分裂繁殖能力而死亡。当细菌菌体失去活性后，银离子又会从菌体中游离出来，重复进行杀菌活动，做到持久抗菌的效果。
催化杀菌则是指在光的作用下，银离子能起到催化活性中心的作用，催化水分子和空气中的氧发生反应，形成活性氧自由基，这些具有强氧化性的自由基可以在短时间内破坏细菌的增殖能力，致使细胞死亡，从而达到抗菌的目的。有研究显示，银离子的抗菌效果主要通过第一种机理实现，也就是接触杀菌。
银离子抗菌玻璃粒子在水中溶解时，在玻璃颗粒中所含有的银，以银离子的形态被释放出来，在水中或和水接触过的物质表面上的细菌将不再有活性，银离子能够直接进入菌体，可抑制多种细菌、病菌的滋生与繁衍，健康抑菌除螨防臭。
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其主要原理为,依托银离子较高的氧化性,与细菌、真菌中蛋白酶上的巯基结合,改变膜的渗透性,在细胞质中损坏DNA结构抑制其复制,让细菌、真菌失活。
银离子有良好的广谱抗菌特性,常见的金黄色酿脓菌、葡萄球菌、大肠杆菌以及皮肤癣菌等真菌都可以进行消灭。
银离子不会伤害益菌和正常细胞，主要是因为一般的病原细菌都是单细胞生物，通过蛋白酶存活。银离子会吸引蛋白酶结合，然后刺穿这种单细胞生物，让其失活，进而达到抗菌抑菌的目的。
此外，经过除菌袋清洗后的衣物，会增加衣物的抗菌效果，不易滋生细菌，产生异味。
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