相传康熙皇帝得了一种怪病，宫中御医把所有的名贵药材都用遍了，就是不见病情好转，他一怒之下停止了用药。这天，康熙独自出宫微服夜游，来到一条街上，发现有一个小药铺。此时，已是夜深人静，小药铺里却灯火通明，还听到那里传来读书声。康熙心想，宫中御医不过是一些庸才，没有什么真本事，真正的人才还是在民间。自古道小药铺内有人参，我何不来这里看看？于是，康熙便上前敲门。
进屋后，康熙见一个四十多岁的人正在烛光下夜读，猜想，他一定是这小药铺的郎中了。郎中见有来客夜访，便问：“阁下深夜造访有何见教？”康熙说：“深夜登门，多有冒昧。只因我得一怪病，浑身发痒，遍体起红点子。不知是何原因？请了好多名医，都没有治好，先生能不能给看一看？”郎中说：“好，请你脱去上衣，让我看一看。”康熙脱去上衣，郎中只看了一眼便说：“阁下不必担心，你得的不是什么大病。只是你平日吃山珍海味太多了，再加上长期吃人参，火气上攻，因此起了红点子，以致发痒。”
康熙说：“好，若能治好我的病，定有重谢。”康熙回到宫中，按郎中所嘱，如法洗浴。果然，他下到浴缸中，就顿时觉得浑身清爽、舒服，妙不可言。连洗三遍之后，竟然全身不痒，再一细看，身上的红点子一个也没有了。康熙十分高兴，第四天又微服来到小药铺。郎中一见康熙面带笑容便知他的病全好了，于是故意说：“阁下今天是送药钱来的？”康熙说：“正是。先生，你说要多少钱？”郎中哈哈大笑：“见笑了，那天晚上见你半信半疑，我才故意说治不好病分文不收，如今病好了还是分文不收。我见你气宇非凡，只想跟你交个朋友罢了，请问，阁下尊姓大名？”康熙微微一笑：“学生姓黄，字天星，一介书生。”
郎中一听高兴地说道：“我叫赵桂堂，也是一个穷书生。父亲立志让我金榜题名，光宗耀祖，可谁知天不遂人愿，多次名落孙山，如今只好在京城开一个小药铺，一面行医，一面攻读，希望有朝一日能来个鱼跃龙门。”康熙说道：“赵兄，常言说，榜上无名，脚下有路。依你高超的医术，我可以力荐你进宫担任御医，岂不是鱼跃龙门了吗？”赵桂堂笑了笑说：“你错了。我以为，行医者应为普天下百姓着想，为他们排忧解难。进皇宫当御医，尽管享尽荣华富贵，可不能为天下老百姓治病，非我所愿，医有何益？”
康熙一听，不禁说：“赵兄的德才令我佩服之至。仁兄，请恕我直言，既然你屡考不中，何不安下心在医道上大展前程？”赵桂堂说：“我也是这么想呀，只是行医也非易事，我没有这么多的本钱，空有淩云之志，也难有大的发展前程。老兄，你若日后发了大财，资助我一把，帮我建一座大药堂，也算我没有白给你看一次病。”康熙一听毫不犹豫地说：“若真要建药堂，叫什么名字好呢？就叫同仁堂吧，你看这个名字怎么样？”赵桂堂见他当真，便笑着说：“刚才我是一句玩笑话，你莫当真。再说，建大药堂需一大笔钱，谁知道你何时才能发大财呢？这是云彩边上的事，远着哩。”
康熙说：“眼下不妨试试。”说着从桌子上拿起笔来，顺手写了一张字条，又盖上印章，然后说：“赵兄，明天你到内务府衙门去一趟，那儿有我的一位朋友，说不定真能管事。”说完，告辞而去。赵桂堂看着匆匆离去的黄先生，心想这还是个怪人呢。第二天，赵桂堂忍不住好奇的拿着字条找到内务府衙门。递上字条不一会儿，就出来一个太监，把赵桂堂领进门内，走过一所院子后，又来到一个大屋子前，太监打开屋门，朝里一指说：“赵先生，这些够不够你的药钱？”
赵桂堂定眼一瞧，不由大吃一惊，只见满屋子全是白花花的银子，他一下子呆在那儿了。这时，只听太监说：“赵先生，万岁爷有旨，你给他看好了病，分文不收，他要送你一座同仁堂，你如愿以偿了吧。”赵桂堂这才如梦初醒，原来自己并不介意要跟他交个朋友的黄兄，竟是当今皇上，真后悔当初自己的荒唐，怎么一点儿也没有察觉出来。果然，没过几天，一座大药铺拔地而起，取名“同仁堂”。赵桂堂搬进新居开业典礼之时，怎么也没想到康熙皇帝竟亲自前来祝贺，慌得赵桂堂束手无策，不知如何是好。
康熙笑着说：“你莫要心慌意乱，你的药钱我可是还上了，下次再看病，你仍得分文不收呀。”从此之后，北京城便有了一个很有名气的“同仁堂”大药房。
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