公元1219年，蒙古成吉思汗向中亚强国花拉子模派出一支450人的商队，试图与此国建立贸易关系。谁知花拉子模贵族利令智昏，以间谍罪为名杀光了蒙古商人，还抢走了他们所有的财宝。
愤怒于花拉子模黑吃喝的行为，成吉思汗决定组织一场史无前例的西征，向复仇火焰烧向中亚大地。此后，蒙古大军一路势如破竹，所到之处皆烧杀抢掠。攻城时，只要遇到抵抗就必然屠城。
首当其冲的是不花剌城，成吉思汗仅用数天时间便攻破此城。破城后，蒙古人堵着各个城门，对百姓进行了惨绝人寰的屠杀。最后，蒙古人放了一把火，彻底烧毁了不花剌。
之后，成吉思汗又攻入了撒麻耳干（意为“肥沃的都市”，今乌兹别克斯坦撒马尔罕）。城中有11万人，其中有6万是突厥康里部人。这些突厥人自恃与蒙古人同宗同种，于是他们暗自打开城门，迎接蒙古攻入。然而令康里人没想到的是，他们对城市的背叛反而引起了成吉思汗的警觉。当天夜里，蒙古人包围了他们的营帐，用弓箭和火焰将他们全部杀死。
随后，成吉思汗将剩余的市民驱逐出城，每200人分成一组，让手下士兵冲入人群中砍杀，以此来磨练骑术。仅仅一天时间，全城市民被杀得只剩几千人。如果不是耶律楚才冒死劝谏，恐怕全城百姓已被杀尽。最终，城内生下的百姓还住不满城中的一个角落。
可怕的屠杀将中亚其他城市吓破了胆，成吉思汗趁机宣布：“只要主动投降，我们将一人不杀，还可让你们保住自己的财产。”在成吉思汗的恐吓下，中亚大城巴里黑城向来犯的蒙古大军主动献上珍贵的珠宝和美女，向成吉思汗开城投降。
对于巴里黑的恭顺，成吉思汗感到非常满意，于是准备放过此城一马。谁知他的大将失吉忽秃忽进谏道：“此城广大，人口繁多，且在我军回师的必经之道上。如此城反叛，我军必然腹背受敌！”成吉思汗一听认为有理，于是他暗中吩咐部下：“进城后立即屠城，老弱不留！”
随后，蒙古大军进入了大门洞开的巴里黑城，城中所有市民都张灯结彩，欢迎蒙古人的到来，大道两旁皆是拜伏的百姓。谁知一个蒙古士兵突然射出一支响箭，其他蒙古大兵皆立即拿出弓刀，对手无寸铁的百姓进行了大规模的屠戮。数天时间内，曾经繁荣的巴里黑城成了人间炼狱，除了少数工匠以及一些妇孺，城中百姓绝大部分都被杀死。
一些剩余的军民惊恐于蒙古人的背信弃义，于是纷纷躲入附近的山中要塞努斯拉托·库。之后，成吉思汗留下偏师，专门围攻这些百姓，并用了6个月的时间攻陷此城，并将剩余的百姓也屠杀殆尽。直到今天，巴里黑城仍然没有恢复元气。
因此，蒙古大军形成了一个原则，“抵抗要屠城，即使投降也可能屠城。”只要城池在蒙古人后退的要道上，那便定然杀害全城百姓。
在花拉子模，最惨重的屠城事件要数玉龙杰赤之战。玉龙杰赤本是中亚第一大城，拥有数十万百姓。为了抵抗蒙古大军，玉龙杰赤整整抵抗了好几个月。城池被攻破后，成吉思汗下令掘开附近阿姆河的水坝，水淹全城。城内百姓大部分化为鱼鳖之食，少部分百姓被后来入城的蒙古人杀尽。
经过蒙古人的洗劫、虐待、威逼、蹂躏，东伊朗从此再也没有完全恢复过来。即使是15世纪的帖木儿文艺复兴运动，也未能使它们完全恢复。 在这次对花剌子模国的战争中，成吉思汗率领他的蒙古军队夷平了一座座美丽的城市，杀害了难以计数的无辜百姓。
都说“人之将死，其言也善”。即使在成吉思汗去世前夕，他仍然对屠城念念不忘。他颁布了三个遗旨，其中一个便是杀尽所有西夏人，璀璨的西夏文明就这样毁于一旦。
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