要想了解《桃花扇》从未被清廷封禁的原因，首先要了解《桃花扇》的作者孔尚任其人。
孔尚任字聘之，号东堂，自称云亭山人。出生于顺治五年，孔子的第六十四代世孙。顺治十二年其入孔孟颜曾四氏学堂读书。
康熙二十二年，康熙皇帝为了巩固政权，笼络汉人，体现“满汉一体”统治政策，初次下江南，此次南巡到山东曲阜，康熙帝拜谒孔庙、举行祭礼并游览孔林，孔尚任作为孔子世孙负责接待工作并为之讲解《大学》。孔尚任自然是殷勤为之，因此受到了康熙的称赏，并被破格提拔，出任国子监博士。孔尚任获此隆宠，得了孔子的庇荫，如若他不姓孔，那会有此殊荣，所以作为孔子的直系传人，以及生于清初的政治环境，他的这份汉人的荣耀和血液里的那种复兴汉文化的使命感，是贯穿始终的。
得以提拔，最初的孔尚任其实是受宠若惊的，一心打算效忠康老大，可惜一出仕就被派往濮阳治水，也不知那康熙心里是啥小九九。就这样，这水一治就是四年，作为文人的孔尚任心高气傲，觉得一介书生，孔子传人，竟做民用工程，这面子、里子的都没地儿搁，心里就无比委屈，怀疑自己只是康熙平衡满汉的工具。就这样日积月累，那心里的小埋怨越来越蓬勃，最后竟芳草凄凄。
康熙何等人物？他六巡江南，其中五次亲自前往明孝陵，祭拜明太祖朱元璋。开博学鸿词科，大兴科举考试，给士人们做官的机会。兴修水利，开垦荒地，减免赋税等等。种种政治手段下，康熙政权越来越稳固。孔尚任小小一介文人，也就只能自怨自艾了，慢慢地便起了宦海沉浮，归隐山林之想。这种想法在《桃花扇》中多处可见，书中一共出现了四十三次“桃花”。柳敬亭说书开头就引用李白的《山中问答》：“桃花流水杳然去，别有天地非人间。”在结尾处又化用了陶渊明的《桃花源记》：“桃花误处，问俺渔郎。”这些都有意无意地指向了一种意象，即桃花源。
《桃花扇》写的是明代末年发生在南京的故事，借儿女之情抒兴亡之感，其追思、哀悼前朝之情是显而易见的。且看书中续四十出《余韵》，老艺人苏昆生放声悲歌：“俺曾见，金陵玉殿莺声晓，秦淮水榭花开早，谁知道容易冰消。眼看他起朱楼，眼看他宴宾客，眼看他楼塌了。这青苔碧瓦堆，俺曾睡风流觉，把五十年兴亡看饱。那乌衣巷不姓王，莫愁湖鬼夜哭，凤凰台栖枭鸟。残山梦最真，旧境丢难掉。不信这舆图换稿，诌一套哀江南，放悲声唱到老。”好一个孔尚任，这兴亡之叹，亡国之恨，真个是写得让人拍手叫绝。《桃花扇小识》也有相同的情绪：“人面耶？桃花耶？虽历千百春，艳红相映，问种桃之道士，且不知归何处矣。”
这样一本书，却从未被清廷封禁，这又是为何呢？
《桃花扇》一书，反映的是南明兴亡史，实际上孔尚任的心思是总结明未腐败亡国之教训，给清朝提供治政之道，这些于清朝廷是有大利好的。其书虽赞颂了史可法、左良玉这样的抗清人物，有反清复明的嫌疑，但要看到孔尚任也是极尽所能地在讨好当朝，如开篇试一出《先声》：“老夫原是南京太常寺一个赞礼，爵位不尊，姓名可隐。最喜无祸无灾，活了九十七岁，阅历多少兴亡，又到上元甲子。尧舜临轩，禹皋在位；处处四民安乐，年年五谷丰登。今乃康熙二十三年，见了祥瑞一十二种。”哪一十二种祥瑞呢？后面说了，有“河出图，洛出书，景星明，庆云现，甘露降，膏雨零，凤凰集，麒麟游，蓂荚发，芝草生，海无波，黄河清。你看这马屁拍的，必须赞一个。
还有《桃花扇》书中对前朝腐败的控诉，也是康熙极爱的，试想走了一个腐败的前朝，还了老百姓一个清明的新王朝，这种思想在民间流传的话，对清朝廷的政权巩固却是极为有利。相对书中孔尚任流露的对江山易主的沧桑之叹、家国之痛，这些个文人小情绪，两者相权，取其重，所以清王朝也就懒得费那个劲去禁止了。然而，康熙还是没让孔尚任好过，《桃花扇》书成数月后，孔尚任就被直接罢官了，之后一直不被起用。
“命薄忍遭文字憎，缄口金人受诽谤。”《桃花扇》书成，皆由孔尚任不被重用，怨念累积所起，因了这股怨念，才让今之人能读到这本集诗赋、词曲、四六、小说于一体的传奇文学，幸甚至哉。
