生物武器是以生物战剂杀伤有生力量和破坏植物生长的各种武器、器材的总称。生物战剂包括立克次体、病毒、毒素、衣原体、真菌等。
生物战剂是军事行动中用以杀死人、牲畜和破坏农作物的致命微生物、毒素和其他生物活性物质的统称。旧称细菌战剂。生物战剂是构成生物武器杀伤威力的决定因素。致病微生物一旦进入机体（人、牲畜等）便能大量繁殖，导致破坏机体功能、发病甚至死亡。它还能大面积毁坏植物和农作物等。生物战剂的种类很多，据国外文献报道，可以作为生物战剂的致命微生物约有160种之多，但就具有引起疾病能力和传染能力的来说就为数不算很多。
在条件合适的情况下，生物武器的杀伤力是相当大的，1979年苏联位于斯维尔德洛夫斯克市（今叶卡捷琳堡市）西南郊的一生物武器生产基地发生爆炸，大量炭疽杆菌气溶胶逸入空气中，造成该市肺炭疽流行，直接死亡1000余人，致使该地区疫病流行长达10年之久。这还仅仅是一次泄漏事件造成的严重后果，在战争期间有意使用生物武器的杀伤力更是惊人。
第二次世界大战期间，日本帝国主义大规模研制生物武器，侵华日军还组建了专门的细菌作战部队，即731部队，开始对中国10余个省份的广大地区施放鼠疫杆菌、霍乱弧菌、伤寒杆菌和炭疽杆菌等10余种生物战剂。1940年7月，日军在浙江宁波用飞机投撒了70千克伤寒杆菌、50千克霍乱弧菌和5千克带鼠疫杆菌的跳蚤。1942年夏，又在浙赣铁路沿线投放了霍乱弧菌、鼠疫杆菌、伤寒杆菌等病菌，污染水源和食物，造成疫病流行，致使大量中国平民死亡。从1940年10月至1945年8月，日军先后多次在浙江衢州各地撒播鼠疫、霍乱、伤寒、痢疾和炭疽等多种传染病病原体，造成衢州各地疫病大流行，数以万计的人员死亡。据1948年衢州5县防疫委员会调查统计，1940年至1948年8月，患上述传染病者达30万人以上，病死者在5万人以上。1941年夏，日军731部队派出远征队，携带大量鼠疫杆菌，在湖南常德一带向当地中国驻军和农村投撒染有鼠疫杆菌的跳蚤，引起该地区发生鼠疫，死者达400多人。11月4日，日军再次对常德实施了细菌战攻击，造成242人染疫死亡。除此之外，他们甚至拿活人做细菌试验，仅此一项就杀死中国军民3000多人。日军的生物武器给中国人民造成了巨大灾难。
2001年“九一一事件”之后，美国国内发生了多起炭疽邮件袭击事件。从2001年9月22日至11月13日，恐怖分子将炭疽杆菌芽孢制成粉末状物，随信件寄往参议员、电视台、广播电台等处。信件在邮件分送、开启过程中，有关场所的空气及环境受到炭疽杆菌芽孢的污染，从而引发炭疽病，造成至少22人发病，5人死亡，引起了全球性的恐慌。
鉴于生物武器的残酷性和对平民的杀伤，世界上大部分国家都对其持否定态度。1975年3月26日，《禁止细菌（生物）及毒素武器的发展、生产及储存以及销毁此类武器的公约》生效。该公约目前拥有165个缔约国，中国于1984年加入该公约。公约主要内容是：缔约国在任何情况下不发展、不生产、不储存、不取得除和平用途外的微生物制剂、毒素及其武器；也不协助、鼓励或引导他国取得这类制剂、毒素及其武器；缔约国在公约生效后9个月内销毁一切这类制剂、毒素及其武器；缔约国可向联合国安理会控诉其他国家违反该公约的行为。
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