喜欢是毋庸置疑的，不过这份喜欢是经历了很多年的生死之交才形成的，甚至可以说是爱。
至于原因，我总结了有如下几点：
1、志同道合和良好关系环境的开端。
小哀第一次出场被组织暗杀到被阿笠救回家逃过一命后就对博士产生了极大的好感，在得知当年被自己毒害却鲜有了解的新一是阿笠的好友的时候就觉得很巧，关系上的确认为以后两者同病相怜的感情奠定了基础，再后来柯南还不计前嫌的一直的照顾安慰嘘寒问暖的关心小哀这使得小哀警戒和悲凉的心被感动，感情更好得到发展。
2、生死友谊到生死至交。
柯南和小哀被组织追杀不是一次两次，更何况还经历了数不胜数的其他犯罪分子的危害（比如蓝色古堡事件）。柯南在每次遇到这些近况的时候总是第一个站到小哀的前面保护小哀，记得小哀和柯南一起去调查被组织杀害的成员的时候小哀出意外的昏迷。
在案发第二现场房屋被烧毁的千钧一发的时候还是柯南把昏迷的小哀主动背出火海逃离死神的魔爪。可以说，在生死至交的付出中，柯南对于小哀的贡献有时候还超过了对于原配小兰的贡献，可见两人的这层关系是经得起各种考验的。
3、柯南周边关系的感化使得小哀爱屋及乌。
这一点我认为最能值得推敲，毕竟柯南周边关系的人员有太多，让小哀能感到柯南的人品是怎样的和柯南能力到底如何这都提供了条件。影响最大的人便是阿笠博士，小兰，以及少年侦探队等。阿笠博士我们不说了，已经完全起到了代替小哀的父母与姐姐的亲人作用，照顾小哀日常还一直体恤小哀的话。
小兰对于灰原哀来说可以用苦艾酒的一句话来形容“white angel”——白色天使，在苦艾酒绑架小哀的那次事件后，小哀得知小兰为了援救被苦艾酒假扮的新初医生软禁走的自己（柯南假扮），不惜冒死躲在罪犯车箱后面跟踪，最后在开枪的时候大无畏的跳出车厢保护她而昏迷，还说了一句“一定要好好的活下去”时就已经感动的五体投地。
从此从反感到无比体恤关心小兰。少年侦探队好比是小哀童年的玩伴与保镖，童真和有规律的生活使得小哀不再希望回到组织阴暗的生活向往自己有一个有亲人和有人关爱的生活。这一切已经成为小哀另一个家的常规，而对于大家长柯南的关注更是得到集中。
4、最后一点便是剧中各种关于灰原哀的感情伏笔。
比如在听到小兰对于新一一直不出现自己好伤心的感情心路，小哀变得更加怜爱小兰与隐藏自己这份感情。在第一次听说工藤有自己的心爱的人时候吃醋与关心的说“喂，你的那位千金小姐没事吧。”足见小哀的情谊。
还有小哀在生活中得到少年侦探队的手捧，让她更加珍惜与柯南的这份情。小哀喜欢偷学柯南的推理思路，也喜欢和柯南吵吵闹闹，在柯南面前对自己的贞洁看的最重要，如果没想错的话还是想把自己的第一次永远给自己心爱的人柯南吧。
小哀在柯南要去清水寺和兰度过休学祭的而要APTX4863的时候故意为难柯南让柯南帮自己找丢失的钥匙链，以及著名的日本歌姬仓木麻衣为柯南配的插曲《爱上恋爱》等等都可以看出小哀喜欢柯南，甚至是爱柯南，但是这份情，可能只是真的暗恋，真的只是单相思罢了。
