截止2021年9月，已经很多论文发布了成吉思汗黄金家族的古代DNA数据，提供了大量的线索。
一、成吉思汗的六世孙 合赞汗的DNA数据 O2a2b1a1a1a2a-Y8389
合赞汗ghazan khan是成吉思汗的第六代孙，伊尔汗国建立者旭烈兀的第四代孙。
被怀抱的婴儿是合赞汗，抱着他的是阿鲁浑汗
2020年，伊朗研究者对于伊朗的蒙古khans（译：可汗）和shahs（译：沙，伊朗对国王的称呼），确认其中ghazan khan合赞汗为O2-M175，预计2022年发布正式论文。
根据后来消息（未经公开证实），合赞汗的Y染色体细分类型为O2a2b1a1a1a2a-Y8389，如果消息属实，则O2a2b1a1a1a2a-Y8389的TMRCA（最近共祖时间）为6600年，根据23魔方数据（共计1521个蒙古族个体），占现代中国蒙古族的0.60%，比例不高，无明显近代扩张。
从Yfull数据看，这个支系目前主要分布在东亚汉族和日本、韩国人中，有河南（2）、黑龙江（1）、重庆（1）、广东（1）、广西（1）和日本东京（1）、韩国（1）。
合赞汗的血统是被一些人怀疑的。施拉特《史集》中记载，合赞汗的母亲（忽里塔qultaq）身边有个叫（伊升Ishink，或 医生 ）的汉人奴仆，该男性奴仆是合赞汗的外祖父（怯塔儿必阇赤kihtar bitikji）从朵儿边部落（中国嫩江流域）的汉人奴隶中挑选给女儿的，一直陪伴其从中国而来，一般的奴仆身份低下，不被人重视，但《史集》特意对此进行详细记录十分不寻常。更糟糕的是，合赞汗的父亲（阿鲁浑）是在13岁时得到的合赞汗，如此早熟当上父亲也受到了一些猜疑。
汉人（伊升Ishink ）的妻子（莫哈里真）后来成为了合赞汗的乳母，合赞汗幼年的老师巴黑失牙鲁黑也是一位汉人，他们和合赞汗的关系是亲密但正常的。
目前，合赞汗是唯一一个被证实的古代黄金家族成员的DNA，他属于O2-M175，但成吉思汗属于这一类型的可能性非常低。
二、金帐汗国高等级贵族DA28
2018年在《nature》上发布的《137 ancient human genomes from across the Eurasian steppes》一文中，有个DA28的古人个体，他的Y染色体是C2-Y4633，母系是D4m2，地址是在哈萨克斯坦的Karasuyr，这个古人的父系类型是“成吉思汗星簇”（C*-STAR，或者写作C2-F3796）的下游，而F3796被目前认为是成吉思汗家族最大的候选类型（根据魔方数据，占现代中国蒙古族的7.93%，是现代蒙古族中最大的一支）。
根据另一篇文章《Ethnocultural code of military groups at Ulus Jochi from the archeology of Karasuyr burial, Ulytau, Central Kazakhstan》的记录，这个墓葬是一个dated between 1270 and 1320 CE（距今约750-700年前），墓葬带有shamanism（译：萨满教）元素的 Tibetan Buddhism（译：喇嘛教）宗教文化。因此上，这个金帐汗国D28的古人，也就成了第一个被发现的“成吉思汗星簇”血统的古人个体，而这个古人恰恰是金帐汗国的一个蒙古贵族个体。
原文中这样描述这个古人个体：
We also find the presence of an individual of West Eurasian descent buried together with members of Jochi Khan’s Golden Horde army from the Ulytau Mountains（译：我们也发现存在一个西欧亚血统个体，与朮赤可汗家族的战士埋葬在一起，在Ulytau山脉。）
This could suggest assimilation of distinct groups into the Medieval Golden Horde, but this individual may also represent a slave or a servant of West Eurasian descent attached to the service of the Golden Horde members.（译：这可能意味着黄金家族由不同文化的群体构成，但也可能这个西欧亚血统的人仅仅是奴隶或仆人，为黄金家族成员进行服务。）
这个古人身份显赫，很可能是黄金家族的远支。他的父系类型C-Y4633是C-Y4580的下游，而C-Y4580产生于1450年前，是疑似孛端察儿的类型。
这个是一个非常重要的线索，金帐汗国的黄金家族远支被发现，对于确定成吉思汗家族的类型非常重要。
三、蒙古草原上13-15世纪的SHG003个体
2020年3月《cell》上发表的《A dynamic 6,000-year genetic history of Eurasia’s Eastern Steppe》的文章，里面SHG003个体是蒙古帝国时期一个古人，原文中没有给出这个古人的具体时期，时间只是13-15世纪的蒙古帝国范围内，发现地点是蒙古国Sukhbaatar （译：苏赫巴托尔省）的Sharga Uul。
SHG003古人是父系是C2-ZQ394，也是“成吉思汗星簇”（C*-STAR-F3796）的下游，是另一个被发现的黄金家族的古人。
C2-ZQ394是一个距今1100年前的父系类型，同样父系的人还被发现在俄罗斯下诺夫哥罗德州 (1）、俄罗斯鞑靼共和国（1）、乌克兰（1）、新疆（1）、内蒙蒙古族（1）、山东（1），这种1100年内的分布，仅可能是蒙古帝国造成的，这个SHG003的古人应该也是一个黄金家族远支。
四、开阿利克遗址的早期个体KLK002
根据《Ancient genomic time transect from the Central Asian Steppe unravels the history of the Scythians》一文的数据，哈萨克斯坦的开阿利克遗址，有个公元950年（距今1070年）的早期个体KLK002，该个体是的类型是C2-F1918，是星簇C2-3796的上游。
开阿利克遗址时间是公元8至13世纪，曾经是突厥部落葛逻禄的都城，这个古人的发现，增加了成吉思汗黄金家族和更古老的部落的联系。
五、乞颜祖地的肯特山唯一的一个古人个体
2020年3月发表的《A dynamic 6,000-year genetic history of Eurasia’s Eastern Steppe》论文中DUU002，这个墓葬具有Circular grave, contains iron stirrup（译：圆形墓、含有铁马镫），他的父系是R1a1a1-Page7。
这个古人的墓葬位置是蒙古Khentii（译：肯特省）Duulga Uul墓地，这个古人是目前唯一一个在乞颜祖地（Khentii肯特省）的古代DNA，论文中给出的该个体时间为1214-1270 CE，从年代看，这个时期蒙古各部落已经打散，很可能是从其他地方迁移而来，该古人不一定源自乞颜部落。
互联网上一些低质量爽文，认为古代乞颜部落是以O2为主的，甚至还有人说成吉思汗的汉人奴仆是O2，所以后代是O2，这个简直是对历史人物的诋毁。
古代尼伦蒙古（乞颜、泰赤乌、主儿乞、晃豁坛）的祖地是 Khentii Aimag（肯特省），论文中只有1个男性古人
DUU002 R1a1a1-Page7
成吉思汗之前的时代，乞颜部落还活动在Tuv Aimag（中央省），该省有3个男性古人
ARG001 R1a1a1b2a2b-Z2122
ARG003 C2b1a1b1-F3830
BAY001 C2b1a1b-F1756
成吉思汗之前的时代，乞颜部落还活动在Dornod Aimag（东方省），有6个男性古人
TSA001 C2b1a1b1-F3830
TSA002 C2b1-F1699
TSA003 C2b1c-F1918
TSA004 D1a1a-N1
TSA005 N1c1-M46
UGO002 O2a2b1a1-Page23
还有一个地区，即Sukhbaatar aimag（苏赫巴托尔省），这个地区不属于乞颜传统地区，有4个C和3个O，网络爽文的做法，是把这里认定为乞颜祖地，这样O的比例就几乎和C相同了。
DAS001 C2b1c-F1918
DEK001 O2a2b1a1a3a-F317
KHN001 C2b1a1b1-F3830
KNN001 O2a1c1a5-M5420
SHG001 C2b1a1b1-F3830
SHG002 N1c1a1-L708
SHG003 C2b1c-F1918
ZAY001 O2a2b1a1a-F8
实际我们不能认为这些地区的人源自蒙古乞颜本部，因为这些古人是13-15世纪的，是元代晚期和明代早期，各部落之间已经打散了界限，人民互相迁徙，这里居住的古人已经来自各个不同部落，甚至还可能有非蒙古的色目和汉人。
五、蒙古国元代黄金家族墓地R1b
2016年9月的《Molecular Genealogy of a Mongol Queen's Family and Her Possible Kinship with Genghis Khan》，在蒙古国的. Sukhbaatar aimag（苏赫巴托尔省）的 Tavan Tolgoi山，在其中墓葬中，有三个古人个体被认为是黄金家族的成员dthe Golden family members (MN0104, MN0125, and MN0126) 。
给出Y数据的三个个体
MN0104 R1b
MN0126 R1b
MN0376 R1a1a
属于高等级贵族的MN0104和 MN0126均为R1b（这两个人最大可能是成吉思汗的外孙，汪古部落的王子，因此父系与黄金家族不同，后面论述）
The 5 graves belong to the Golden family members who were contemporaries of Genghis Khan,（译：与成吉思汗同时代的5个墓葬）
MN0104 was unearthed holding an ornament, called “Jins” in Mongolia, consisting of a large pearl mounted on a flower-shaped golden base （译：MN0104墓穴，有一种称为“金”的装饰物，由一颗大珍珠组成，镶嵌在一个花形的黄金底座上）.
MN0126 and MN0127 were each wearing only a single earring that was found under the skull, indicating their higher social status（译：MN0126和MN0127每个人都戴着一只单耳环，出现在头骨下，暗示他们的更高的社会地位）
MN0376 was also believed to belong to a member of the general public（译：MN0376也被认为是属于普通大众）
文章最后给出两种可能：
①女性贵族（MN0124）是 Alaqai Beki（成吉思汗的女儿），MN0104和 MN0126是他的儿子Ongud（汪古部落王子）。
②女性贵族（MN0124）是Sorghaghtani，她是Mongke（蒙哥） 和 Kublai（忽必烈）。
这两种假设，文章认为也存在不足，无法定论。
六、成吉思汗家族最大的可能性
目前看，仍是星簇（C2-F3796）下的子类型，C2-Y4541，距今约950年，稍后的文章更仔细进行分析。
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