传说，抚仙湖的名字来源于一个神话故事。深居天宫的玉皇大帝步出宫门，远眺人间，发现一颗形如葫芦的明珠，美丽至极玉皇大帝为之倾倒，急传肖、石二仙立即下凡，描摹这人间美景，带回天庭，装点天宫。
但是肖、石二仙只顾搭手抚肩地观看，并赞叹不已，竟痴痴迷迷地忘了画画，忘了归期。一日复一日，一年复一年，他们定定地站在那里，陶醉在迷离美景之中。久而久之，两位神仙变成了两座石峰搭手抚肩、俯视明珠，故称“抚仙湖”。
不过，更令人们注意的是抚仙湖至今为止有八大未解之谜。因为抚仙湖的水清澈见底、晶莹剔透，被古人称为"琉璃万顷"。据说在风平浪静时，站在附近的山顶，可以隐约看到抚仙湖下有一座古城。
1992年，一个叫耿卫的潜水员在抚仙湖东北面水域，发现湖水在这里变浅。他便下潜至水下约9米的地方，看到长满水垢和青苔的石梁，顺着石梁向下，发现这里的地质状况非常奇特，由此引出震惊全国的水下古遗址。
2005年考古队进驻抚仙湖，进一步的探测，发现古城是有8座建筑组成的古建筑群，其中一座高20米、相于十层楼高的金字塔形建筑物最引人注目。接着又发现了一个底座宽为63米、高21米类似古罗马“斗兽场”的巨大建筑，在建筑群中间，还有一条300米长、7米宽镌刻着精美图案的石板路。
考古队初步考证，这是一座2000前的古城，很可能是历史上记载的俞元城。据记载：西汉王朝在抚仙湖一带设立了俞元城，可是俞元城到隋唐以后再没有任何记载。澄江当地一直流传这样的传说，“俞元古城和人都沉到湖底”。很多专家倾向于认定水下城市就是俞元城。
第二个未解之谜便是：海马。据道光《澄江府志》“杂异”载：“在抚仙湖中，有物如马状 ，浑身洁白，背负红斑，丈尺许，时出游水面，迅速如飞，见者屡获吉应。”同样的事件，最近的记载是民国年间的《江川县志》，记载过海马的出现。
第四个未解之谜：湖中存有大鱼。抚仙湖里面的大鱼，可不是一般意义上的大鱼。1992年禄充村渔民从抚仙湖中捕到一条大青鱼，长155厘米，重64公斤，此鱼曾用药水作防腐处理，在禄充博物馆展出。随后，又有一条重达73公斤的“青鱼王”被捕获。
第五个未解之谜：万鱼朝圣。每年的夏秋时节都能看到东南水域大约一两百亩的水面上，黑压压一大片，全是将近半米长的黑色青鱼，一个挤一个，浮在水面，全部绕着岛游动，场面相当宏大，仿佛是水中万国来朝一般，是极其罕见的水族盛况。
第六个未解之谜：怪石界鱼。抚仙湖和星云湖中间的隔河上，有一块“界鱼石”，抚仙湖的抗浪鱼和星云湖的大头鱼，游到此处各自回头，形成了有名的“两湖相交，鱼不往来”的奇观。有人说那石头似一个龇牙咧嘴的猫头，它的倒景在河里，鱼儿怕猫，所以不敢越界。
抚仙湖不是海洋，却她的美与神秘都可与海洋比肩。关于抚仙湖的故事，就像湖水一样不停流淌，在人们的口口相传中，抚仙湖愈加神秘迷人……玉溪抚仙湖，就是那个值得让你停留的存在。
