西南诸岛的九良岛上，有三个旷工在里面很慌张的想往外跑，后面一束光扫过，它他们一瞬间变成了石头。
TPC接到报告，前来搜索，派了调查员4人进去，外面的工人在向小队长了解里面的情况，在工人口中得知了岛上有怪兽，小队长就想从工人口中了解怪兽情况，工头不相信，另一边，调查员在搜索过程中，有两人直接被怪兽的爪拖走，有一个直接被变成石头，剩下一个慌忙逃走，出去刚好给小队长说了岛上真的有怪兽，其他人都被变成石头了，工人听了很慌，说一定是加库玛。
胜利队办公室里，队长等三人正在寻找哥尔赞的踪迹，但是一无所获，这时，收到泽井总监的通知，说九良岛出现了一头怪兽，采石场的旷工遭受攻击，命令胜利队采取措施，但是胜利队目前并没有能和怪兽战斗的武器，于是，下达了把飞燕号改造成战斗机的命令，就这样，着手开始了把胜利队的飞机改造成对付怪兽用的战斗机改造计划，丽娜和崛井留下来帮忙。
九良岛这边，泽井总监来到岛上，想从见过加库玛的工人口中得知一点怪兽的消息，前面还好好的，但是说到怪兽头上还长着一个角时，产生了争论，有人说一个有人说两个，总监就觉得没有人真正的见过加库玛。
同时，在胜利队办公室里，野瑞正在给大古讲解巨人的形态以及巨人在地球上只能出现3分钟，1.初始形态——比较均衡的一种，2.红色形态——力量比较大，但是速度比较慢，能让敌人产生极大影响的，3.蓝色形态——速度灵敏但是力量比较弱。大古有所感悟：巨人可以依据敌人的特征调整自己的力量变换形态来作战。
九良岛这边，TPC的员工在山上埋下了许多炸药，同时用热感监测着加库玛，想等它出现把它炸死，但是炸药似乎对加库玛没有用。
办公室里，野瑞不解：为什么复苏的只有一个巨人，于是又打开了装载了幽怜的时光机，关键部分还是听不到，大古听到了，疑惑的看向野瑞，原来，后面的声音只有大古能听到，后来野瑞出去买饭了，大古在办公室从幽怜口中又听到了巨人的名字，以及自己能变成迪迦的原因：自己DNA里隐藏着伟大古代英雄战士的基因，大古生气摔了神光棒，又从幽怜口中得知几千万年前，巨人消失的原因。
还没说完，野瑞端着饭进来，看到地上的神光棒，捡起来询问大古，这是不是他的，大古慌张的从野瑞手里夺回神光棒，承认这是他的，正准备吃饭，总监的通讯就来了：命令胜利队立刻出发，队长接到命令，询问飞燕号的改造结果。丽娜和副队长驾驶着飞燕1号出发了，改造是成功的，但是没测试过，驾驶员和飞机在磨合中，才发射了一次，就被怪兽的身体给拱下来了。
清醒过来的副队长赶紧架着丽娜逃跑，千钧一发之际，崛井等人开着飞燕2号的超强模式及时赶到，救下了副队长丽娜，总监和队员正在发表感言的时候，崛井刚说完才一下不过瘾，想再跟怪兽交手，话落周围就摇晃起来，长着两只角的加库玛出现了，原来加库玛不止一只。
危机时刻，大古变成迪迦奥特曼出现，与怪兽展开激烈的打斗，途中，迪迦被怪兽的光线射中，正从脚往上慢慢变成石头，迪迦变成红色形态解决了面前的威机，还把怪兽的两只角打掉了，最后释放了一个光球，怪兽卒，化为石头回归土地。
回到基地，办公室里，正在感慨着今天的一切，大古提出给巨人取个名字，副队长提出的巨山超力霸被否决了，大古又提出了，叫他迪迦奥特曼，大家都觉得不错，于是巨人的名字迪迦奥特曼就从胜利队开始往外传……
