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肠道真菌菌群是人类肠道微生物组的一个微小但非常关键的组成部分，参与调节宿主同源性、病理生理过程以及共存于肠道的细菌微生物组的组装。在过去十年中，越来越多的研究对健康和多种病理条件下的肠道真菌菌群进行了研究分析，研究结果表明，肠道真菌菌群与肠道细菌菌群协同在人类健康和各种疾病中发挥着至关重要的作用。
2022年9月28日，中山大学左涛研究员在Lancet Microbe（IF = 86）发表题为“The gut mycobiome in health, disease, and clinical applications in association with the gut bacterial microbiome assembly”综述，该综述回顾了健康人群从出生到成年过程中肠道真菌群的组成和功能多样性，从影响肠道菌群的因素（包括饮食、药物、年龄、遗传和免疫系统）、肠道真菌菌群在疾病和治疗中的作用特别是它们与肠道细菌菌群和宿主免疫的协调作用等角度进行分析，对肠道真菌菌群的基本组成和转化研究的最新进展进行了综述，明确了致病性、益生性和条件性真菌在疾病发生过程中的作用，强调了肠道真菌-细菌相互作用在宿主生理学和病理生理学中的生态效应。
该综述还讨论了肠道微生态疗法中肠道真菌的作用，并强调将理论转化为临床实践的途径，特别是在临床治疗方面，利用肠道真菌菌群、细菌微生物组和宿主免疫之间的三方关系，恢复肠道真菌菌群和微生物组以提高临床疗效。
除了细菌和病毒外，人体胃肠道也是大量真菌的寄生之处，寄生数量占肠道微生物数的0.1%，这些真菌在维持人体健康和肠道稳态中起到至关重要的作用。肠道真菌群的失调与许多疾病发生相关，包括自身免疫、代谢、神经系统疾病和癌症，如肥胖、糖尿病、炎症性肠病（IBD）、结直肠癌和阿尔兹海默症等。
图1：肠道真菌群和宿主免疫之间的相互作用与细菌菌群的组装有关（ASCA: 抗酿酒酵母菌抗体；Treg: 调节性T细胞；Th17: 辅助性T17细胞）
肠道中条件性致病性真菌的定植和生长会诱导宿主免疫反应失调，从而影响疾病发生进程。 肠道真菌特别是念珠菌，会影响肠道细菌微生物组（另一种主要的宿主生理调节因子）的组装和功能。这些肠道真菌、细菌和宿主免疫之间相互作用的机制是人类免疫同源性的基础，对维持机体健康和疾病的发生、发展都有影响。然而，在基于微生物群的治疗方法开发过程中，肠道真菌在很大程度上仍然被忽视，现有的真菌群研究结果也没有在临床实践中得到充分利用。
图2：宿主肠道真菌和细菌之间的跨界相互作用
这篇综述主要从肠道菌群在健康人群的作用、各种疾病中的肠道菌群的生态失衡及其有害作用和肠道真菌-细菌-宿主免疫三者之间错综复杂的关系以及肠道菌群的临床应用（包括粪便微生物群移植（FMT）、饮食干预、抗真菌素、益生菌和抗生素）等多方面进行了讨论和分析，旨在总结该领域的相关基础和转化研究以及相关临床研究的最新进展，以提高研究人员对肠道菌群在健康人群和各种疾病病理发生过程中扮演角色的理解，将肠道真菌群、细菌群和宿主免疫联系在一起，为更好的临床实践提供重要信息。
图3：基于肠道菌群改造的临床治疗途径
生长良好的肠道真菌群与细菌群之间互惠关系对于人类健康至关重要，在未来，将肠道真菌群作为精准医疗方法的一部分用于疾病诊断、预后和治疗干预是非常可能的。在肠道真菌群和细菌菌群以及人类病理生理学基础、转化和临床知识基础上，未来的微生物靶向治疗应该定向协同调节肠道真菌和细菌，这将对提高临床疗效具有一定的促进作用。
原文链接：
https://www.thelancet.com/journals/lanmic/article/PIIS2666-5247(22)00203-8/fulltext
来源：iNature
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