No.10目暮警官
嫌疑指数：★★☆
名侦探柯南中不少事件都有目暮警官在场，而且常常草草了事，胡乱得出结论，而且与小五郎的胡乱推测配合的相当好，虽然表现得对柯南一副漠不关心的样子，但可能在背地里观察他。强大的警力与强大的职权，也能为黑衣组织提供不少便利。
No.9赤井秀一
嫌疑指数：★★★
虽然是FBI的调查员，但是表现的十分冷酷的样子，或许是无法表现出热情的样子，很有老大的风范。而且枪法、推理能力都堪称一流，所以说他是幕后黑手并不过分。
No.8黑羽快斗
嫌疑指数：★★★☆
著名的怪盗基德，喜欢偷东西然后再返还回去，人气颇高。当小偷的原因是父亲黑羽盗一被杀，快斗想要找出真凶，所以成立了这样一个组织（本来快斗就很有钱的说）。彻底的除掉一些人，可以为自己提供不少便利（我不认为他会这么做，应该是手下的人擅自行动的吧）。
No.7黑羽盗一
嫌疑指数：★★★☆
黑羽盗一，怪盗基德（快斗）的父亲，据说在一次魔术表演中被杀，但我可不认为他这么容易就会死掉。为了寻找宝石，得到永恒的寿命或是为了救人之类的，成立了黑衣组织，并在一次事故中佯装死亡，幕后操纵黑衣组织活动。
No.6铃木园子
嫌疑指数：★★★☆
不多说了，有钱能使鬼推磨，铃木财团的庞大资金可以解决一切。
No.5吉田步美
嫌疑指数：★★★☆
不要被娇小可爱的外表欺骗了，可能她就是幕后黑手。虽然柯南中有出现过，说贝尔摩德是“那个人”的恋人，但是谁规定女性之间就不能……或许步美从一开始就是喝药变小的，然后潜伏在柯南周围进行观察，表现出的娇弱与无能则是为了让柯南放松警惕……
No.4灰原哀
嫌疑指数：★★★★
APTX4869的开发者，由于决策的失误，被迫吞下了变小药。由于变小的身躯无法操控组织，只好在暗地里进行操纵，所以柯南中并没有出现任何黑衣组织Boss的消息，因为这个Boss已经出现好几次了！
No.3工藤优作
嫌疑指数：★★★★
新一的父亲，为了让孩子体验不一样的人生，或者是为了积累自己的写作素材，成立了黑衣组织。凭借优作不劣于新一的推理能力，完全有可能掌控黑衣组织。
No.2阿笠博士
嫌疑指数：★★★★☆
为什么新一家附近会有这么一个奇怪的博士？明明能发明出各种各样实用的道具，却不投放市场，这么强大的头脑，却仍然没有豪华的住宅，没有得到国家重用。最有可能的是他就是黑衣组织的Boss，为了研究搞一些材料什么的，觉得新一碍事就准备杀掉他，结果没死反而变小了。但是变小的新一也对他造不成什么威胁，所以放过他了。
No.1毛利小五郎
嫌疑指数：★★★★★
从一些事件中可以看出，小五郎有着胜于新一（柯南）的推理能力，常日的疯疯癫癫只是表态，是为了让人放松对自己的注意而故意装出来的。新一（柯南）一直给他打麻醉针，而他连医院也不去看看，足见嫌疑之大，而且枪法、格斗技都堪称一流，很有可能是黑衣组织的Boss。
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