在科研、工程应用、生活中,我们所获取的数据往往包含着很多冗余信息,这些冗余信息往往对数据分析造成干扰,增加数据分析的复杂度。此时我们则需要对这些数据进行预处理,预处理的原则是:既能抓住其主要特征,又能剔除冗余信息,从而减少数据量。PCA降维就是这样的一种数据预处理算法。

本文首先讲解PCA降维的计算原理,再使用C 与Opencv来实现该算法,并与Opencv现有的PCA函数接口进行降维结果的对比。看到这里,可能有人会问,Opencv都有现成的函数可以调用了,为什么还要自己去写呢?我想说的是,对于学习者来说,重复造轮子并不是坏事,它可以让我们更加深刻地理解造轮子的过程,从而才有改进和创新的机会,相反,如果只是使用别人造好的轮子,不深刻理解其构造原理,压根就没有改进创新的空间了。

1. 计算原理

假设有m行n列的数据,计为矩阵X0,其每一行数据看作一个一维行向量,那么该数据本来有m个一维行向量,我们要使用PCA降维算法把其降为k个一维行向量(k < m),计算过程如下:

(1) 求出每行数据的平均值。

(2) 去平均处理,把每行数据都减去本行数据的平均值。

(3) 去平均处理之后,同样得到m行n列的数据,计为矩阵X1。

(4) 按以下公式计算X0的协方差矩阵,其中“*”表示矩阵乘法,得到的协方差矩阵Cov为m行m列矩阵:

pca算法进行降维的过程是什么(PCA降维的计算原理与应用)(1)

(5) 计算协方差矩阵Cov的特征值与对应的特征向量。得到m个特征值,对应m个特征向量,其中每个特征向量的长度又为m,也即所有特征向量组成m行m列的矩阵。

(6) 将特征值按照从大到小排列,并根据排列后特征值的顺序来按行从上到下排列特征向量(每个特征向量为一行),使特征值与特征向量仍保持对应。

比如本来特征值依次为a1,a2,a3,a4,a5,对应的特征向量为:

v1

v2

v3

v4

v5

排序之后,a3>a1>a4>a5>a2,那么特征向量的顺序也作对应的调整:

v3

v1

v4

v5

v2

此时计特征向量组成的矩阵为V。

(7) 取矩阵V的前k行数据,得到k行m列的矩阵P,计算Y=P*X1,Y矩阵即为最终得到的k行n列的降维数据,从而实现把数据从m维降为n维。

上代码:

voiddo_PCA(Matsrc,Mat&pca,intk) { if (src.rows <= 1 || src.cols <= 1) { return; } k = k > src.rows ? src.rows : k; Mat src_float; src.convertTo(src_float,CV_32F); //求每行的平均值 Mat col_mean = Mat::zeros(1, src.rows, CV_32FC1); float *col_mean_p = col_mean.ptr<float>(0); for (int i = 0; i < src_float.rows; i ) { float *p = src_float.ptr<float>(i); for (int j = 0; j < src_float.cols; j ) { col_mean_p[i] = p[j]; } } col_mean /= src_float.cols; //去平均值 for (int i = 0; i < src_float.rows; i ) { float *p = src_float.ptr<float>(i); for (int j = 0; j < src_float.cols; j ) { p[j] = p[j] - col_mean_p[i]; } } //计算协方差矩阵 Mat X = src_float*src_float.t(); X = X / src_float.cols; Mat eValuesMat, eVectorsMat; //调用opencv接口计算特征值与特征向量 eigen(X,eValuesMat,eVectorsMat);//这里得到的特征值已经按照从大到小排序了,特征向量也与特征值相对应 Mat Vectors_k; eVectorsMat(Rect(0,0,eVectorsMat.cols,k)).copyTo(Vectors_k);//取特征向量的前k行,k*r pca=Vectors_k*src_float;//k*r*r*c=k*c pca=pca.clone();//确保矩阵连续,拷贝一份 printf("pca.rows=%d,pca.cols=%d\n",pca.rows,pca.cols); }

测试代码:

void pca_test(void) { Matimg=imread("lena.jpg",CV_LOAD_IMAGE_GRAYSCALE); intk=100;//从图像原有的m行降为100行,列不变 Matpca_m; do_PCA(img,pca_m,k); imshow("原图", img); imshow("本文实现算法 PCA降维后", pca_m); //使用Opencv的PCA函数接口 PCApca(img,Mat(),CV_PCA_DATA_AS_COL,k); Matdst=pca.project(img);//dst则为最终降维数据 imshow("Opencv PCA降维后",dst); waitKey(0); }

运行上述代码,得到的结果如下。可以看到,本文实现的算法与Opencv函数的计算结果是一致的,说明我们的计算过程没错,鼓掌~再接再厉~

pca算法进行降维的过程是什么(PCA降维的计算原理与应用)(2)

原图

pca算法进行降维的过程是什么(PCA降维的计算原理与应用)(3)

本文实现的PCA算法的降维结果

pca算法进行降维的过程是什么(PCA降维的计算原理与应用)(4)

Opencv现有的PCA算法的降维结果

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