关于成都的武侯祠，据《太平寰宇记》载：“李雄称王，始为庙于少城内，桓温平蜀，城内独存孔明庙。”
据说，蜀汉时全国人口不超二百万，蜀汉时的成都，仍是大城少城两座城，大城内有宫殿和住官吏，少城住平民商贾，两座城的人口不超十万。
《晋书》中记载了一个桓温问吏的小故事，讲的是：桓温征讨蜀地，遇见了诸葛亮当政时期的小官吏，当时他已经一百多岁了。桓温问他:“(你觉得)现在有谁比得上诸葛丞相吗?”小官吏回答道:“诸葛亮在世的时候，也没觉得他有多么了不起，自从诸葛亮去世以后，再没有见过能比得上他的人了。”
桓温感念诸葛亮的忠诚，未毁少城内的武侯祠。
时间飞逝，人事更迭，战乱纷纷，城旗变换，多少英雄沉寂，多少人家绝祀。乱世顾活命，盛世重祭祀，少城武侯祠（孔明庙），没有了诸葛亮后人或政府的支撑，应该也在时局动荡中荒废淹没了。
据史载，约在公元500年左右的南北朝时期，武侯祠从成都“少城”迁建惠陵、汉昭烈庙旁，这种格局大致持续到明代。
关于迁建这种说法，木林以为可信度不是太高，主要是为了名义上的延续，是为了给新祠一个冠冕堂皇的说法。对于孔明庙这种在历史上有影响人物的祠庙，到底是官方，还是地方缙绅大户独资，或是民众集资募捐，官方史志、地方志以及当地的民间传说中，都没痕迹记载，确实是一种遗憾。不过，这也许正说明，成都自桓温伐蜀后的政局民生，并不如正史记载，或者我们想象中的那样繁华稳定。木林以为，如果用重建、重修，可能更务实恰当，这个观点还需要专业人士继续进行史料挖掘证明。
公元748年（唐玄宗天宝七年），唐玄宗正式下诏，以朝廷国家的名义把诸葛亮列为忠臣，春秋二季择日祭祀。唐宣宗时，成都尹李回为诸葛亮设专门的“守陵户”，开始四时祭祀。
公元970年（宋太祖开宝三年)，宋太祖颁布诏令说：“前代功臣、烈士，详其勋业优劣以闻……蜀昭烈帝、关羽、张飞、诸葛亮……皆勋德高迈，为当时之冠。”将刘、关、张纳入由国家祭祀的对象，由朝廷正式下诏设守陵户，诸葛亮等每人三户。
宋人为达到“以臣伴君”的目的，在惠陵左右不远的地方又先后修建了关侯祠、张飞祠。
《太平寰宇记》中记载：“关侯祠、张飞祠俱在府西南七里惠陵左右，宋庐陵王立。”武侯祠区域的外延进一步拓展，才真正地形成了一片以武侯祠为中心的“三国文化区域”。
再后来，主要是明蜀献王朱椿的合并以及清朝的后续重建功劳。
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