古董局中局2完美收官，在第一部的佛头案尘埃落定之后，许愿的大名也被更多人所熟知，然而老朝奉的势力并没有被彻底消除，随着许愿进一步的追踪查探，老朝奉的神秘面纱终于一层层被揭开。
同出五脉的药不然佛头案之后背着背叛五脉的罪名神秘失踪，一个偶然的机会许愿五脉里有人在参与制假贩假，一个为了古董倾家荡产的商人，拿着五脉的鉴定证书和宝贝一起找到了许愿鉴定，许愿当场就发现这根本就是一件赝品，商人承受不了这样的打击跳楼自尽了。而电话那端卖给他东西的人正是药不然。
从小一起长大的世家情谊和追踪制假贩假集团首领老朝奉的责任都驱使他要马上见到药不然问个究竟。
二人见面之后，许愿发现药不然此时已经成为老朝奉的手下，他对于自己的身份坦然承认，眼神中却流露出不能言说的隐情。当年的五脉如今已经改制成了中华鉴宝会，而会长刘一鸣正是五脉中的书画鉴定大家，他忧心五脉会分崩离析，特邀请许愿接替许家代言人，在五脉大会上，许愿冲动之下拿出了流通在市面上给赝品做的五脉鉴定证书，当场砸碎了赝品震动了五脉各族。
去伪存真本是五脉鉴宝的祖训，可如今却成了造假者的保护伞，就在许愿离开之后意外得知有人在背后搞鬼《清明上河图》，直指故宫里的藏品为赝品，这件事引起了这个行会的震动，许愿也被牵扯其中，他费尽心力寻线前进发现有人在试图和老朝奉抢市场，正在这时他接到了老朝奉递来的橄榄枝，提议派药不然与许愿合作揪出制造假《清明上河图》的人，几经辗转许愿终于发现对方那个神秘公司手里掌握的只是和真迹问世时间很接近的一副仿品，纸质做工都十分相近难以分辨。
就在《清明上河图》的真相被许愿揭开的同时老朝奉再一次全身而退，许愿的情绪变得十分焦躁不安，药不然发现此时的许愿就跟当年离开药家的自己一样，于是把许愿带到了一个神秘的拓碑作坊，当许愿得知这个拓碑点是给老朝奉提供制假材料的时候，情绪十分抵触，慢慢他发现这个拓碑师傅对老朝奉的行为根本一无所知，拓碑师傅的敬业精神感染了许愿，他甘心留下来拓碑，经过无数次的失败他终于成功拓下了一张完整的碑文，也从中悟到了沉稳对于人生的重要。
尽管许愿一时还搞不清楚药不然为老朝奉做事到底是为了什么，但从小一起长大的两个人情谊还是在的，在药不然爷爷药来的故居中他们发现了一个惊天的秘密，药来留下的青花人物罐被五脉的沈先生借走了，而这个青花人物罐里藏着的正是当年许家先祖在海上击沉的那艘沉船的定位图，沉船上装着十个天青釉的柴窑，是稀世珍品，他们立即觉得老朝奉肯定是盯上了这十件柴窑。
在追寻中许愿爷爷和药来的太爷之间恩怨也终于大白于天下，原来许愿爷爷发现日本人盯上了这座沉船准备打捞，于是想尽办法前去阻止，就在马上要踏上征途的时候许一城被沈先生的父亲出卖被捕入狱，在执行死刑之前药来的太爷药慎行前来狱中探望二人定下了大义之约，药慎行秘密代替许一城前往公海继续阻止日本人拿走国宝，而许一城背负着叛国之名冤死在枪口之下。
如今许愿追寻先辈足迹，发动政府的力量与警察方震一起准备再探沉船，就在大家准备开拔的时候，五脉以木器著称的沈先生也匆匆赶来要一同前往。
经过一番惊险的探寻，他们终于找到了当年的沉船，在下海探查的过程中药不然和许愿在船舱相遇并带回了死在船舱里药慎行的遗骸，药不然此时终于明白先祖为何赶赴公海，他再次潜入水底用炸药把沉船炸入了海沟之中，用自己的行动完成了先祖的遗愿。
但由于潜水时间过长药不然陷入了深深的昏迷之中，许愿灵机一动和同行的伙伴一起制造了药不然将醒的假象，因为经过一系列惊心动魄的事件他已经可以基本断定老朝奉此时就在这艘船上，也只有他才是那个最不想药不然醒来的人。
这一招果然奏效，他苦苦追查多年的老朝奉终于露出了庐山真面目，正是木器鉴定世家的女儿沈先生，被发现的她站在船头，面向广阔的大海她坦言了一切，原来她是沈家收养的女儿，她的亲生父亲正是当年陷害许一城的姬钧天。
这是一场正义与邪恶的较量，也是匠心与贪欲的抗争，在天理昭彰的循环里老朝奉终于自尝恶果，以跳海结束了她贪婪的一生。
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