哈工大是一校三区，哈尔滨总部两个校区、威海校区，另一个就是深圳校区，以前叫深圳研究生院。
为什么说不是分校而是校区呢，在哈工大本部的汽车学院整体迁入威海校区是一个转折点，现在威海校区的汽车专业实力都是非常强悍的，在那不久威海分校正式更名为威海校区，由此开始了与本部互补的学科建设，包括海洋学院等。
首先在高考的时候本部应该要高于分校12-20分左右，虽然二者有很多专业不同，但是威海分校的社会名气还是不足。甚至有些人还会认为威海是哈工大下属的一个学院，二本、专科那类的性质！
哈工大威海分校建校历史只有20年，本部历史都快90年了。威海分校比较小，有些专业只有威海分校有，比如车辆工程。但是在总体上来考虑，威海分校的师资没有本部那么强。去威海分校的很多学生是报本部分不够从而调剂过去的，但是威海分校也培养了很多人才。
哈尔滨工业大学深圳校区目前主要是研究生教育，前身是始建于2002年的哈尔滨工业大学深圳研究生院。2014年5月，教育部批准哈尔滨工业大学深圳研究生院筹备举办本科教育。深圳市与哈尔滨工业大学签署新的合作办学协议，在深圳研究生院基础上筹备共建本硕博教育体系完备的“哈尔滨工业大学（深圳）。
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