招安后，作为卢俊义的麾下，燕青南征北战，参与了征辽国、征田虎、征王庆、征方腊的战役。
征战辽国时，燕青随卢俊义攻破太乙混像阵，在双林镇巧遇故友许贯中，获赠三晋山川城池关隘图。
本次相遇，燕青看到许贯中住处云轻风静，月白溪清，水影山光，相映一室，心中不免有所感触，许贯中一番当今奸邪当道，妒贤嫉能的话，如此明智的提醒，使燕青以后的归宿或者说结局，似乎有了一个大概的方向。
征田虎时，燕青献上许贯中制作的何处可以屯兵、何处可以埋伏、何处可以厮杀的三晋山川城池关隘图，宋江、吴用嗟叹称赞不已，燕青虽无具体战绩，却也献图有功。
征王庆时，龙门关之战卢俊义失利，全亏了有先见之明的燕青调了五百步兵在平泉桥附近搭建浮桥，方使卢俊义大军得以渡河，挽救了二万将士的性命。
征战方腊时，燕青化名云碧，随柴进诈降方腊，取得方腊的信任，清溪之战，燕青协助柴进，杀了有万夫不当之勇的方杰，引大军攻入帮源洞，彻底端了方腊的老巢。
征战方腊结束，出于对主人的养育之恩，燕青私下劝卢俊义激流勇退，隐姓埋名，寻个僻净处，以终天年。
而卢俊义却要衣锦还乡，封妻荫子，舍不得荣华富贵，非但听不进燕青的忠告，还反过来笑话燕青。
燕青笑道：“主人差矣！小乙此去，正有结果，只恐主人此去无结果耳。”最后，卢俊义果然落了个被奸佞之徒下水银中毒，醉酒失足淹死水中的悲惨下场。
时间验证了燕青的先见之明，卢俊义的不识时务，苦把功名恋，只怕功名不到头，令读者君不禁对燕青肃然起敬。
燕青不愿朝廷恩赐，收拾了一担金珠宝贝，竟不知投何处去了，宋江收到燕青托军人送来的书信，其中的四句话，让宋江心中郁挹不乐：“雁序分飞自可惊，纳还官诰不求荣。身边自有君王赦，洒脱风尘过此生。”
燕青性格不张扬，处事低调，顺遂性情，却见识长远，有着敏锐的洞察力，可谓有过人之才，其智慧足以辨奸料敌，勇猛足以冲锋陷阵，是梁山泊不可多得的人才。
有功于梁山，而不持才傲物，才华横溢的燕青，让读者君顿生好感，并为之折服，燕青可以说是梁山泊一百单八将中最有人格魅力的英雄好汉。
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