1.孵化前的准备
①孵化器与孵化室的清洗、消毒在正式开机入孵前， 首先熟悉和掌握孵化器的性能，然后对孵化器进行运转检查和温度校对，并对孵化器内外彻底清洗，然后孵化室、更衣室喷雾消毒，再将孵化出雏机内外彻底消毒。孵化过程中每出一批雏对孵化器消毒-一次，可用高锰酸钾.福尔马林熏蒸，其比例为每立方米高锰酸钾15g，福尔马林30mL，熏蒸20~30min。消毒时应避开2~3日龄的胚胎。孵化室空间的消毒可用消毒液喷洒，地面用1% ~ 2%的火碱水浸泡消毒。
②保持孵化室内良好的通气和适宜的温度一般孵化室的温度以22C左右为宜，不得低于20C，亦不应高于24C，夏季气温高时尽可能采取措施降低室内温度。室内湿度应保持在55%~60%。为保持这样的温湿度，孵化室应严密，保温良好，孵化室的窗户要小而亮，光照系数(指窗户的进光面积与舍内地面面积的比)以1:(15~20)为宜。孵化室应有专门的通气孔或风机，以保持孵化器和孵化室的空气清洁、新鲜。孵化器要离开温源，并避免日光直射，以免影响内部温度。孵化室的地面要坚固平坦，室内要有蛋盘架的设备以便于工作。
③孵化器的检修与试温孵化器内一 旦入孵种蛋，至少连续运转26~ 28d,为了避免中途发生故障，在开机前应对孵化器进行认真检修，着重检修加热、加湿、翻蛋、通风系统是否能正常工作，调控系统是否灵敏，并对温度计进行校对(以体温计为标准，将备用温度计与一体温计同时浸入38C水中，两边之差为备用温度计的差值)，确认一切正常时，可试车。一般在正式入孵前2 ~ 3d开始试车，把孵化器内的所有条件按照孵化的要求调整，待调控灵敏、温度稳定、运转正常时可消毒、入孵。同时，孵化前应准备好一系列的孵化记录表格，主要有孵化进程表、孵化记录表、孵化管理表等。
2.入孵
当孵化准备工作就绪后，即可上蛋正式孵化。将待孵种蛋按大头朝上码盘，装入蛋车，记录蛋的数量、品种、入孵时间等，将蛋车推入孵化室(25C的环境下)预热12h,可装机。装机时将蛋车沿轨道推进，并用卡子卡紧。一般入孵的时间安排在下午4: 00以后，大批出雏时可在白天，工作比较方便。
3.通风换气
胚胎在发育过程中，不断地吸收氧气和排出二氧化碳，为保持胚胎的正常气体代谢，必须供给充足的新鲜空气。刚入孵的前3d可将进出气孔全部关闭，有利于升温和节省电力以后根据孵化器的使用说明打开进出气孔，并经常检查风扇是否正常运转。
4.翻蛋
在孵化前、中期(0~ 25d),通过翻蛋，可以避免胚胎与壳膜粘连，使胚胎各部位受热均匀，有助于胚胎的正常发育。采用自动翻蛋时，将定时器定到2h翻蛋次， 翻蛋的角度应达到90°，每次应记录翻蛋的方向，如前倾或后倾，左倾或右倾等。若采用人工手动翻蛋，翻蛋的速度要缓慢，翻蛋的角度要确实。在用摊床孵化时，可人工翻蛋，每4~ 6h翻蛋1次，翻蛋角度为180° ，原着床面经翻转后变为向上面。孵化后期，胚胎已覆盖绒毛般不会与壳膜粘连，可停止翻蛋。
5.晾蛋
由于鸭蛋中脂肪含量较高，孵化的中后期，脂肪代谢增强，产热量增多。鸭蛋个体大，散热性能差，容易出现超温，因此，孵化中后期必须晾蛋。一般情况下， 孵化到第14~ 15d后，由于胚胎的自温能力增强，加之有的孵化器蛋盘间距离小，会出现超温现象，应晾蛋，以散失蛋内多余的热量。晾蛋的方法见孵化条件部分。
6.照蛋
目的在于观察胚胎发育是否正常，如发现不正常，可找出原因，及时调整孵化条件，以便获得良好的孵化效果，并将无精蛋、死胚蛋、破壳蛋等剔除。一般进行3次，一般肉鸭第 1次在入孵6~ 7d时进行，将无精蛋、裂纹蛋捡出;第2次在13~ 14d (番鸭15~ 16d)时，主要将死胚蛋和臭蛋捡出，以免孵化时变质炸裂:第3次般在25~ 26d (番鸭30 ~ 32d) 时，一边落盘 边验蛋， 剔出后期死胚蛋。目前，一些大型孵化厂 般只照前2次。 每次照蛋时将室温升高到30C，拉出一个 蛋车或抽出部分蛋盘照检，其他胚胎继续孵化，待照完该部分后，将其推回机内，然后拉出另一部分，直至照完。照检过程中将无精蛋和中死蛋剔除，空位用活胚补充，以便统计。25 ~ 26d移盘，即把胚蛋由孵化器移入出雏器，移盘时因蛋壳较脆，动作要轻，防止蛋壳破裂。移盘后要加大出雏器内的湿度，降低温度。
7.落盘
具体时间应根据胚胎发育的具体情况而定，在气室已明显弯曲，气室下部黑暗，气室内有啄的阴影即可。一般在25d即可落盘。落盘时，速度尽量要快，尽量缩短落盘时间，以免温度下降太多而影响出雏率，特别是在冬春季节。落盘后应多注意观察出雏机内的温度、湿度及通风情况，从最大程度上提高出雏率。
8.出雏
孵化条件控制适宜时27 ~ 27.5d开始出雏，出雏时要求安静，光线暗，不可经常开门，出雏器内空间大时，可进行一次出雏;空间小时，分3~ 4次捡出，每次将毛干的捡出，蛋壳扔掉，动作要快，以防捡雏时间太长，机内温度过低。捡完雏后要换水(最好是温水),地面喷水，增加湿度。捡出的雏鸭存放到温暖的存放室，等待雌雄鉴别和疫苗接种。之后进行选择，过数装箱，准备外运。
9.人工助产
到28d后该出壳的雏鸭基本出完，对已啄壳但无力出壳的弱雏可进行人工助产。对于早已打嘴但尚未出雏的，若发现毛干，壳膜发黄的，可人工将蛋壳破开，将雏鸭的头颈舒展，若在助产过程中发现出血，应立即停止。
10.清扫、消毒
出雏结束后，必须及时对出雏机、孵化机、孵化室等进行清扫和消毒。出雏盘、水盘冲洗干净后放入出维机箱内，进行熏蒸消毒。
11.停电时的应急措施
孵化厂要准备发电机，以备停电时使用。如果没有发电机或发电肉鸭健康养殖与疾病防治宝典机出现故障，可采取下列措施:将孵化室升温到37"C,打开机门，每半小时手动翻蛋次， 地面喷水。
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