手册报关是海关免税监管方式的一种：一般分为进料加工手册、来料加工手册。其进口原料及辅料时不需交纳关税，只是将其进口的数量登记在海关发放的手册上，出口时再在手册上登记出口成品的数量，再完成合同或手册到期时海关将核对其进料和出口成品的数量。如果有转为内销则需要补交进口关税。
杭州口岸：浙江出入境检验检疫局质检证书（换证凭单），进口报关单（复印件）修理协议中英文，情况说明，出口发票，箱单，报关单。
上海口岸：商检质检证书，进口报关单；修理协议中英文，情况说明，出口发票，箱单，报关单。关保函；产品保修卡。
办理报关手册流程：一）、办（第一次）新手册所需资料
1. 安装加工贸易管理系统(软盘密码JY—Soft Ware)；
2. 填写业务资料并发送，审批通过把出口成品、进口料件、单耗表清单打印出来盖公章；
3. 进、出口合同盖公章；
4. 加工贸易企业《在手手册执行情况表》盖公章；
5. 生产能力证明（正本）；
6. 代理加工贸易委托协议书；
手册千万不要超量
不要出现未进先出（倒挂）的现象
注意手册有效期（每本手册的有效期是1年，1年内必须进出口完毕，如果没有进出完，可以展期，展期一次最多半年，每本手册最多2次。）
尽量按照手册的单耗来报出口。
每本手册一定要出完，如果没有出完需要补税。
出口币制要与手册备案币制一致。
关于税费的免除:凭进料加工、来料加工手册，直接对进口原料进行保税，不存在先交后退的情况。加工成品出口，同样持手册对出口成品予以保税。待复出口完成后，由手册经营单位持尚未核销手册到所在地国税局办理进料（来料）加工免税证明，凭此免税。手册核销，需要对加工原料余料补缴进口环节税，避免走私。对于一些手册尚未审批的加工项目，经营单位可以申请先全额缴纳相当于进口税款总额的保证金给通关口岸海关，并予以进口，待手册办理完毕后，向海关出示，保证金将被退回。除此之外，根据海关113号令，海关可以在几种情况下，认为该贸易风险较大，要求经营单位全额交纳保证金，可以认真查阅一下。应为交纳的是保证金，而不是实际意义上的税款，因而不存在“退税”的问题。
清关资料：
一）、进口报关所需所料
1.直接进口需：报关委托书、合同、箱单、发票（供应商提供）、进口报关单、手册、（提货委托书）；
2.以结转方式进口需：报关委托书、合同、发票、箱单、其它关区的需要关封。
二）、出口报关需要资料
客户的进口报关单、销售合同、发票、装箱单、报关委托书、出口报关单
办理货物出口时，除了加工贸易报关，有一般贸易报关，那一般贸易报关是什么？
一般贸易是与加工贸易相对而言的贸易方式，是指中国境内有进出口经营权的企业单边输入关境或单边输出关境的进出口贸易方式。其交易的货物是企业单边售定的正常贸易的进出口货物，一般贸易进出口货物是海关监管货物的一种。《海关法》规定，货物或运输工具进出境时，其收发货人或其代理人必须向进出境口岸海关请求申报，交验规定的证件和单据。接受海关人员对其所报货物和运输工具的查验。依法缴纳海关关税和其他由海关代征的税款，然后才能由海关批准货物和运输工具的放行。
一般贸易货物在进口时可以按一般进出口监管制度办理海关手续，这时就是一般进出口货物；也可以享受特定减免税优惠，按照特定减免税监管制度办理海关手续，这时就是特定减免税货物；也可以经海关批准保税，按照保税监管制度办理海关手续这时是保税货物。
一般贸易和手册贸易方式主要区别:
1.一般贸易（General Trade）原料是国产的。
2. 手册贸易通常分为:进料加工和来料加工。
进料加工:属于以出带进，靠出口促进进口，进口料件和出口成品单独作价，分签进口和出口合同，分别付汇和收汇。一般需要有经营单位自己解决原料来源。 原料是从国外进口的，出口的时候可以发往任何一个地方。报关单是红色的。
来料加工: 一般只签署加工合同，属于接受国外加工委托，单纯的劳务输出，收取工缴费（可以理解成加工报酬）。来料加工，由外商负责不作价提供加工原料，交付工缴费，收取加工成品，进出口环节保税。原料从哪里进口的，货物要出口到哪里。
3. 手册贸易不需要交关税和增值税，而一般贸易需要交关税和增值税。
详细内容可参考：《中国海关报关实用手册》
