在小说《神雕侠侣》中，杨过一生遭遇了很多不幸。而在杨过少年时期，他的不幸在很大程度上是黄蓉造成的。《神雕侠侣》中的黄蓉不像《射雕英雄传》中那样温柔善良，反而心机深沉，让人心生厌恶。因为看杨过不顺眼，且对杨过心生忌惮，黄蓉不仅在杨过与大武小武发生争执时拉偏架，还故意不教杨过武功，让他持续被自己女儿和大武小武欺负。也正是在这种情况下，郭靖带着杨过上了终南山，杨过又在阴差阳错下拜小龙女为师。
黄蓉与杨过
黄蓉与杨康的恩怨黄蓉那么大一个人，为何处处与一个小孩儿过不去呢？很多人认为可能是因为杨过他爹的缘故。杨过的父亲杨康年轻时认贼作父，在得知身世后不仅继续追随仇人完颜洪烈，而且还打算继承完颜洪烈的王位。他在桃花岛上以九阴白骨爪杀害了江南七怪中的韩宝驹，后来被黄蓉在铁枪庙揭穿。杨康想杀黄蓉灭口，结果一掌打在黄蓉的软猬甲上中毒身亡。
杨康
虽然杨康的死不是黄蓉故意的，但与黄蓉却脱不开关系。如果杨过知道是黄蓉害死了他父亲，那日后必然会复仇。所以黄蓉不教杨过武功，就是担心养虎为患。除此之外，令黄蓉讨厌杨过的另一个原因是：小时候的杨过十分顽皮。郭靖、黄蓉夫妇初见杨过时，曾询问杨过的姓名，结果杨过称自己是“倪劳子”占郭靖的便宜。郭靖傻傻地听不出来，但黄蓉却岂能不知？所以杨过一开始在黄蓉心目中就印象不好。
杨过生母秦南琴难道就因为这些，黄蓉才处处为难杨过？其实不然。黄蓉讨厌杨过，最根本的原因还是源于他的母亲。在金庸新修订的《神雕侠侣》以及电视剧中，杨过的母亲都是穆念慈。但在连载版的《射雕英雄传》和旧版《神雕侠侣》中都提到，杨过的母亲乃是秦南琴。而黄蓉恨她的原因，则是因为她曾对郭靖有过暧昧的情愫。
郭靖与黄蓉
郭靖与黄蓉分开后，在江南西路界内偶遇了捕蛇的秦南琴爷孙。这爷孙俩以捕蛇为业，受官兵欺凌，郭靖出手相助，赢得了秦南琴的好感。后来秦南琴带着郭靖深夜捕血鸟，更是留下了一段刻骨铭心的经历。虽然郭靖心中只有黄蓉一人，但黄蓉可不允许别的女人惦记郭靖。而且在郭靖与黄蓉练功时，秦南琴为二人遮伞。由于秦南琴偏心郭靖，导致雨水浸湿了黄蓉的衣裳，这都让黄蓉所不满。
秦南琴
郭靖离开秦南琴家中后，秦南琴被铁掌帮的匪首捉到。匪首为了讨好杨康，便将秦南琴送了过去。当时杨康正在穆念慈处受挫，气急败坏之下，就拿秦南琴发泄。没想到，秦南琴竟阴差阳错地怀上了杨过。日后，她逃离杨康，回到故居产下一子，此子便是杨过。一天，她带着儿子去捡柴，丐帮的彭长老路过，见她姿色可人，便上前非礼。
杨过与黄蓉
黄蓉讨厌杨过的主因秦南琴敌不过彭长老，差点再次受辱。这个时候，郭靖再次出现救了秦南琴母子。而杨过这个名字，便是郭靖为秦南琴的儿子所起。后来秦南琴带着儿子杨过在江西长岭下生活，在一次捕蛇的过程中不幸被一条异蛇咬伤，因为没有救治的蛇药，秦南琴毒发身亡。杨过也从此过起了漂泊流浪的生活，直到遇见郭靖夫妇。
杨过夫妇
秦南琴虽然没有与郭靖相恋，但她一直对郭靖情根深重。杨过是情敌的儿子，黄蓉又岂能容下他？所以这才是黄蓉讨厌杨过的真正原因。但因为金庸后来在修订版中删掉了秦南琴这一角色，将杨过的母亲换成了穆念慈，才让黄蓉对杨过的恨有些“莫名其妙”。
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