雨一直下，这是孱弱雨隐村的真实写照。在忍者战争不断的年代，雨隐村成为各大国交战的战场。断壁残垣，破碎的雨隐村到处是战争留下的孤儿。长门、弥彥，小南，就是第二次忍者大战中的遗孤！
三忍与半藏之战结束后，偶遇长门等三个孤儿，自来也不禁起了恻隐之心。看着这单纯又无助的战争孤儿，自来也决定留下来教授他们生存技能，直到他们可以在这恶劣的环境中可以生存下去，也算是一点点对战争中无辜生命的补偿。
3年的相处，长门等3人从自来也身上学到许多，以掌握必备的生活技能及忍术。大蛤蟆仙人曾预言，自来也的弟子将会引导忍者世界变革。
自来也一度认为大蛤蟆仙人所说的预言之子是拥有轮回眼的长门，直到火影剧情不断推动，谜底逐渐被解开。自来也死在爱徒长门操控的佩恩手中，在沉入湖底的过程中认为鸣人才是那个预言之子。其实预言之子其实是两个！
长门认为只有忍界感受到痛处才能迎来真的和平，所以才会下达捕捉尾兽的任务。在捕捉九尾中，木叶的确感受到了痛楚，这痛处不亚于当年九尾爆走所带来的损害。等在外执行任务的忍者回到木叶被眼前的景象所震惊，这还是记忆中的木叶吗？
这一切都来自长门，这个自来也曾经一度坚信的预言之子所带来的摧毁。
“预言之子”会在自来也的徒弟中诞生，而这个预言之子会拥有着翻天覆地的力量，能给这个世界带来前所未有的和平，又或者是彻底的毁灭。
长门无疑是带来毁灭的预言之子，在执念下几乎摧毁木叶，以暴制暴并不能让战争停下，也不能真正迎来和平。
晓组织捕捉尾兽的行动及月之眼计划让忍者意识到各国之间的利益纠缠及隔阂，也意识到晓组织已不仅是一国的问题，而是全忍界所要面对的难题！
长门曾言在自来也三部曲中，自己是老师失败的作品，而自来也豪杰却十分精彩，鸣人作为第三部更是寄托了众多希望。
长门最终被鸣人说服，也试着把和平的愿望寄托在鸣人身上。
预言之子长门篇几乎到这算是完结了，自来也在雨隐所收的三个徒弟相继离世，这个拥有轮回眼的预言之子把和平的希望给予了另一位预言之子。
新的主角登场，鸣人将来续写自来也三部曲的完结篇，而这部也将是自来也的经典之作供后人翻阅......
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