首先，普刊和水刊是有差别的。
通常我们说的水刊具备以下条件：
1）一年内发文量巨大（一年几千上万篇）
2）刊登文章存在大量不严谨甚至错误的内容
3）同行评审中风评较差
4）刊登文章创新性低、原创率低
5）交钱就能安排文章发表
交钱即可安排发表论文
实际上我国官方没有对期刊进行“水刊”的定义，只是部分学校有颁发文件要求本校师生发表在某些刊物的论文不能用作评奖评职称的材料，传着传着就导致某些刊物有了“水刊”的名号。
例如按华东某大学的文件通知，国内绝大多数期刊都是水刊、负面期刊。可实际上名单内的绝大多数刊物都适用于其他高校评奖评职称。
因此，在选择刊物发表时只要选择符合本校对期刊的要求，基本上是没有什么坏处的。
某高校通知
现在什么是普刊？
首先正规期刊都在新闻出版总署备案并公开发行，具备合法的国内国际刊号（CN ISSN号）的省级、国家级期刊，但是当通过某些权威机构对刊物进行认定后，一些刊物就脱离了普刊范畴成为了核心期刊，譬如每4年一次的北大核心期刊，南大核心期刊等。
简单来说，我国把期刊分为普刊和核心期刊。核心期刊包括北大核心、南大核心（CSSCI）等；普刊包括剩下的省级、国家级期刊。
仍不清楚的同学只要明白北大核心或南大核心都是在知网上可以查到的，并且在知网内检索期刊首页时有以下任一一种标志都是核心期刊：
知网《马克思主义研究》期刊
而没有这两种标志的期刊基本就是普刊（包含一些学报 CSCD期刊 SCD期刊）。
那么，发表普刊会有什么坏影响吗？
1.如果你今后不准备从事科研的路，就只是因为大创结项、保研参营、研究生毕业、评优评奖、职称论文等需要发表一篇论文，那么有没有影响因子，是不是知网都不重要，只需满足是正规期刊、符合本单位的级别要求即可。
如果你是准备今后就投身于科研之路，或者争取成为高校教授等学术专家，那应该将目标放在更高的顶级期刊上，那样才会让你的科研有质的进步。
2. 在职称评审时，像工程师、经济师、会计、基教教师、医生护士通常会选择满足评审要求的刊物中性价比最高的普刊。本身他们并没有太多精力投身于学术论文写作方面，而发表顶尖期刊存在许多困难，仅仅只是为了满足职称晋升要求的情况下，他们通常写出的文章也只能够被普刊采用。
就算单位内部竞争激烈，也请不要走上找代写的道路。(代写是学术不端)
3. 不存在学术不端的影响。普刊也是正规期刊，发表论文看的不仅是期刊质量，还要看作者本人的论文水平，如果自己的论文没有抄袭、作假等行为那就不是学术不端。
抄袭、拼接他人论文
最后，发表什么级别的普刊，其实取决于自身的学习、科研等综合能力，在保证论文具有一定的创新性、原创性的情况下，就算发表普刊也不存在污点问题。
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