夸美纽斯作为一位新旧交替时代的人物，他的思想对于当时社会有着重要的指导意义。他提出很多著名的教育理论为后人对教育的研究奠定了基础，同时也影响了历史的发展和社会教育的发展走向。在现在社会，他的思想仍具有很大的影响。
夸美纽斯在继承前人思想的基础上，提出了一套系统、全面的教育理论：夸美纽斯第一次提出了“泛智论”、完整的学制、班级授课理论。他提出的“教育适应自然”原则对后来的很多大教育家产生了很大的影响；夸美纽斯是西方历史上较早提出比较系统的终身教育思想的教育家。他的思想为后来一系列的教育改革运动以及很多思想家教育理论的形成有很大的奠基作用。
夸美纽斯认为教育应是周全的教育，所有的人，都应在智力、德行和信仰方面得到培养。所谓教育，应包括智育、德育和宗教教育，除了这三种教育外，也还要顾及到身体是否健康。
他认为在智力，德行，虔信三方面的教育，应尤其重视德行和虔信的训练，他认为只有知识的进步而无德行和虔信方面的进步，便不能算是进步。
一、泛智论
他企图以泛智论为基础建立他的哲学体系。作为“泛智论”的核心的则是他的泛智教育。所谓泛智教育，就是要求人们学习广泛的知识。所谓广泛的知识，并不是要求人们确切地或深刻地懂得一切艺术和科学。泛智教育是指：“我们希望人人都去学习的是存在中的一切最重要的事物的原则、原因与用途。”“我们希望，把一切知识领域中的精粹的总和灌输给他们的头脑。要是他们知道一切必须熟悉的东西，理解一切事物的原因，懂得一切事物的真正有益的东西。”②
夸美纽斯在泛智教育的教学内容中提出了一个非常重要的原则，就是所学习的东西，一定是对生活有用的东西。泛智教育不是为学习而学习，而是“为生活而学习”。在泛智教育中，还应包括对于学生的行动的训练，为其将来的生活做准备。
从泛智教育所要达到的目的来讲，夸美纽斯的教育思想已大大超出了中世纪经院哲学的思想范畴，它已在很大程度上是近代型的思想。这种与生活相联系的教育思想继承了文艺复兴时期蒙旦等人的思想精华。但是夸美纽斯到底还是一个没有超出宗教教义羁绊的神学家，在他的教学内容中，还包括“笃信宗教的本质、核心与内容。”夸美纽斯身上的旧时代的负担使他的思想不可避免地常常处于矛盾之中。
在泛智教育中，还包括了各种语言的学习。其目的是为了使学生的语言达到完善的程度，使他们能够准确地运用语言。应学习的语言，出本民族语外，就是拉丁语、希腊语和希伯来语。
二、教学方法
夸美纽斯主张的教学应通过感官来进行，以及教学应能使学生积极、自觉、主动地学习，教学应贯彻主动的发展原则等等。
在教学中他往往把演绎法和归纳法结合起来。演绎法即一切知识都应该从有关事物的不变的原则去推演。归纳法即任何知识都不应该根据书本去教，而应该实际指证给感官和心智。
夸美纽斯关于教学的系统性原则，也是非常值得注意的问题。就是要把从前所学的与后来所学的结合起来，这种结合是学科前后联系本身的要求，是学科体系本身的特点所决定的，也符合儿童心理发展的规律，即儿童的智力是在合理的教学中不断发展和完善的，是符合教学的科学规律的。
夸美纽斯提出把艺术和科学当作一种百科全书式的整体来教，这是非常值得人们注意的。这一点，说明了知识的相互联系，相互渗透。夸美纽斯告诫老师，不要把知识当做一种无联系的杂乱无章的一堆木头，而应使学生看到其中的确实关系和联系。
从这个原则出发，他要求一切可以联合在一起的事物、科目都应该联系在一起进行教学。
夸美纽斯正确看待记忆的问题。他认为，所学的知识，只有牢固的把它们记住，才算是属于自己的东西。他认为记忆是理解的前提，只有理解了的东西，才能自然而牢固的记住。
夸美纽斯在教学理论上一个较为突出的贡献就是他对于班级授课制的确认和发挥，并给予理论的证明。他提出了班级授课的基本要求。应该按年龄的顺序来划分班级，每年开学的时间应有统一的规定。教学的时间应该做详细的划分，务使每年、每月、每日、每时，都有一定的工作。各个班级的功课都应该仔细地分成阶段，要有严格的教学计划，并按计划进行教学。
三、学制
根据儿童心智发展的进程，它把青少年的身心发展划分为四个时期，即婴儿期、儿童期、少年期和青年期。相当于这个时期的学校是母育学校、国语学校、拉丁语学校和大学。在这四级学校里，儿童的智力根据各级学校的教学任务和学习内容而使儿童的心智得到循序渐进的发展。
夸美纽斯是一位伟大的民主主义教育家，他对人类充满了热爱，尤其对穷人，被压迫的人，充满了同情。他继承路德的普及教育思想，认为人人都应受教育。
夸美纽斯提出了很多重要的理论，但他的教育思想是有一定局限性的。受基督教神学的影响，他的思想有一定的宗教色彩。另外，他没能结合当时的社会根源深度剖析广大底层人民没能接受教育的深层次原因。他的思想对当时的社会是具有启示意义的，但是当今的社会他的自然适应性原则与这个时代有一定的矛盾。他根据自然来对人的发展阶段进行划分，是受到当时的社会条件限制的，如今在高度发达的科技社会，他的思想有一定的指导意义，但真正适合现在儿童发展的理论还是要在实践中不断探究才能得到的。
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