秦琼和尉迟恭，都是唐朝开国大将，他们武艺相当，可谓是隋末唐初武力的双雄。甚至到了后世，他们均升格为神，一个手持双锏，另一个手持双鞭，成为护佑家族平安的门神。
但是从李世民对他们的封赏来说，秦琼却远不能和尉迟恭相比。首先在凌烟阁，尉迟恭排名第17， 实封一千三百户；而秦琼排名最后，实封才七百户。在决定李世民以及其势力命运的玄武门之变中，李世民亲率尉迟恭等九人埋伏于门内，击杀了李建成和李元吉；而秦琼虽然参与了这次事变，却被李世民留在了玄武门外，负责抵挡太子东宫以及齐王府的援兵。
既然是狙杀李建成和李元吉，自然要带最强悍的斗将，那么李世民为啥只带尉迟恭，而不带秦琼呢？而这就要从秦琼投唐的说起了。
秦琼本是隋朝大将张须陀的部将，为人悍勇无双。但在大海寺之战中，张须陀中计为李密所杀，秦琼最终归降于瓦岗军。公元618年九月，瓦岗军在王世充手上阴沟翻船，几乎全军覆没，秦琼、程咬金、牛进达等将领被迫归降于王世充，而秦琼做了王军的龙骧大将军。
然而王世充为人奸诈，不讲义气，因此不为瓦岗军众将所喜。其后，秦琼等人与投靠唐朝的李密取得了联系，暗中商定投靠唐朝。唐武德二年（619年）二月，秦琼、程咬金等人趁唐郑两军于九曲对阵之时投奔了李唐，被唐高祖李渊安排到秦王李世民府上任职。要知道，当时秦琼等人的家眷还在洛阳，他们为了自己心中的信念甚至连妻子儿女都不顾。
公元619年11月，秦琼随李世民征讨宋金刚，谁知宋金刚手下悍将如云，其中尤以尉迟恭为最。在战斗中，尉迟恭屡破唐军， 唐俭、于筠等唐将均被俘虏。
为了对抗尉迟恭，李世民派秦琼和殷开山在美良川截击尉迟恭，并且大获全胜，斩首2000余人。武德三年，宋金刚以残部2万余人与李世民决战，此战中秦琼一马当先，击破敌军北阵，随后李世民率领精骑掩杀，唐军大获全胜，而尉迟恭也在此战中被李世民收入帐下。
可以说，秦琼与尉迟恭武勇大体相当，但从领军作战来说，秦琼还是要稍胜一筹。美良川之战中，秦琼立功最多，因此受到了唐高祖李渊的青睐。李渊遣使赐以金瓶，还鼓励他说：
“卿不顾妻子，远来投我，又立功效。朕肉可为卿用者，当割以赐卿，况子女玉帛乎？卿当勉之。”
秦琼不顾妻子儿女，与敌军奋战，甚至得到了李渊的赞叹。李渊甚至说，如果秦琼想吃自己的肉，他甚至可以割下自己的肉。宋金刚灭亡后，李渊又赐予秦琼黄金百斤、杂彩六千段，授上柱国的爵位。可以说，与秦王府诸将相比，秦琼并不是李世民的家臣，而是社稷之臣。
与秦琼相比，尉迟恭更像是李世民的打手。在战场上，尉迟恭屡次救李世民于水火之中。例如在与刘黑闼的战斗中，李世民陷入敌方重围，尉迟敬德率领勇士冲进包围圈，大败敌军，帮助李世民突破重围。
在对阵王世充的战斗中，敌方勇将单雄信单骑突阵，一直杀到李世民面前。结果又是尉迟恭的一声怒喝，制止了单雄信的进一步行动。战后，尉迟恭一身是伤，大多都是为了保护李世民而留下的。
因此，秦琼虽然是李世民的老部下，但同时也亲近于李渊。而尉迟恭则不同，他只对李世民一人效忠。因此在诛杀李建成、李元吉以及对李渊进行逼宫时，秦琼都不是一个好的选择。面对恩主李渊，秦琼很可能会心慈手软，但是尉迟恭却绝不会。
在玄武门之变中，李世民亲手射杀李建成，并在追杀李元吉时坠马。其后，李元吉用弓弦勒住李世民的脖子，眼看就要反败为胜。结果尉迟恭拍马赶到，不仅救下了李世民，还亲手杀了李元吉，立下了头功。
这还没完，李建成和李元吉授首后，李世民又派尉迟恭入宫“保护”李渊。结果尉迟恭浑身披挂，提着建成、元吉的首级去见李渊。很显然，若李渊不肯退位，并传诏让东宫和齐王府的援兵退兵，杀人不眨眼的尉迟恭可能会杀死李渊。就这样，李渊起草诏书，解散了东宫和齐王府的精兵，李世民大获全胜。
由于李渊对秦琼有恩，李世民绝不会让他随自己诛杀建成和元吉。相比之下，李世民让秦琼与长孙顺德等人守卫玄武门，阻挡敌方援兵。一方面可以发挥秦琼万夫不当的勇力；另一方面，可以让秦琼避开“杀兄屠弟逼父”这一人伦惨剧。事实上，这也是李世民对秦琼的一种厚待。
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