自理报关的业务流程：
自理报关是指由进出口货物收发人自行办理报关业务，根据我国海关目前的规定，进出口收发货人必须依法向海关注册登记后才能办理报关业务。具体的业务流程如下：
总的来说，自理报关企业需要进行网上录入、申报、查询、打印报关单，以及网上查询海关回执等操作。
1、自理报关单位录入业务流程：
（1）自理报关单位持“报关单录入”操作员卡的操作员进入中国电子口岸“报关单录入”界面，可先下载本企业征免税证明、加工贸易手册或加工区备案清单后，脱机录入报关单数据（数据暂存在本地数据库）；
（2）录入并提交后将录入的报关单数据信息上载到数据中心，进入自理报关审核申报业务流程；
2、自理报关审核申报业务流程：
自理报关单位持“报关单审核申报”操作员卡的操作员进入中国电子口岸的“报关单审核申报”界面，对报关单的逻辑性、填报的规范性进行审核，确保报关单可以向海关进行申报。
若审核不通过，则需要将报关单下载到本地进行修改，修改后的报关单需重新上载到数据中心，并且需要重新进行审核。
审核通过后进入自理报关申报确认业务流程；
3、自理报关申报确认业务流程：
（1）自理报关单位持“报关单申报确认”操作员卡的企业管理人员进入中国电子口岸“报关单申报确认”界面，对报关单进行确认申报操作，经“申报确认”后的报关单通过公共数据中心传到海关内部网。
如果申报确认时认为报关单的填制不符合逻辑，需要将报关单数据下载到本地进行修改，修改完毕之后需要将数据重新上载到数据中心，并且重新进行审核和申报确认。
（2）自理报关单位打印出经海关审核通过的报关单，并携带其他单证去海关办理其他通关手续。
代理报关业务流程：
进出口代理向海关报关时，需提交以下单证：进出口货物报关单。一般进口货物应填写一式二份；需要由海关核销的货物，如加工贸易货物和保税货物等，应填写专用报关单一式三份；货物出口后需国内退税的，应另填一份退税专用报关单。
货物发票。要求份数比报关单少一份，对货物出口委托国外销售，结算方式是待货物销售后按实销金额向出口单位结汇的，出口报关时可准予免交。
陆运单、空运单和海运进口的提货单及海运出口的装货单。海关在审单和验货后，在正本货运单上签章放行退还报关贡，凭此提货或装运货物。
货物装箱单。其份数同发票。但是散装货物或单一品种且包装内容一致的件装货物可免交。
出口收汇核销单。一切出口货物报关时，应交验外汇管理部门加盖"监督收汇"章的出口收汇核销单，并将核销编号填在每张出口报关单的右上角处。
海关认为必要时，还应交验贸易合同、货物产地证书等。
其它有关单证：
（1）经海关批准准予减税、免税的货物，应交海关签章的减免税证明，北京地区的外资企业需另交验海关核发的进口设备清单；
（2）已向海关备案的加工贸易合同进出口的货物，应交验海关核发的"登记手册"。
代理报关是相对于自理报关来说的，两者都是针对进出口货物报关来讲的。
代理报关又分为直接代理报关和间接代理报关。
直接代理报关是指报关企业接受委托人的委托，以委托人的名义办理报关业务的行为。
间接代理报关是指报关企业接受委托人的委托，以报关企业自身的名义向海关办理报关业务的行为。
有权办理代理报关的企业应具备的资格：取得报关企业注册登记许可在海关注册登记。
自理报关与代理报关的区别：
自理报关：假如你公司有自营进出口权，并且在海关有注册登记，另外你公司有自己的报关员，那么报关员就可以自行前往海关报关。
代理报关：如果你公司有自营进出口权，并且在海关有注册登记，但是你公司没有自己的报关员，那么你公司就需要委托其他拥有报关资质的专业报关公司（报关行）代理报关，一般都是以贵司的名义去向海关申报，只不过去报关的是报关行的报关员，你需要支付代理报关费。
