1947年4月23日至5月3日，乌兰夫（云泽）在王爷庙（今乌兰浩特市）召开内蒙古人民代表会议，会议决定5月1日为内蒙古自治区成立纪念日，民族区域自治在全国第一个得以实现，当时内蒙古下辖呼伦贝尔、纳文慕仁、兴安、锡林郭勒、察哈尔盟，计32个旗、1个县、3个县级市，面积54万平方公里。自治政府驻地为王爷庙，此后王爷庙改名为乌兰浩特。
当时，因为乌兰浩特相对关内比较偏远，为了战时需要，中央决定1949年将内蒙古省会迁到了张家口市（今属河北省），为绥远起义做准备。绥远起义后，1954年，中央撤销绥远省建制，将其并入内蒙古自治区，而张家口则划归河北省，由此内蒙古省会定为归绥，稍后改名为呼和浩特。
在此期间，内蒙古的版图一直在变化，当时的昭乌达盟（今赤峰）、呼伦贝尔盟和哲里木盟（今通辽）曾划给东北、阿拉善盟曾划给宁夏和甘肃；现在内蒙古的版图是1979年才最终确定的，但各盟之间版图也一直在调整，比如巴彦淖尔盟的乌拉特前旗原属包头，武川和达茂旗原属乌兰察布盟，等等。
相对于其他两个过去的首府，呼和浩特地处内蒙古中枢，便于管理整个自治区的各盟市，而乌兰浩特的位置相对偏北，张家口则只是过渡期首府，这些可能是导致首府最终搬迁到呼和浩特的主要原因吧！
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