《延禧攻略》70集落幕，却留下不少谜团让剧迷满脑子疑惑，有网友在微博爆料其实原本有94集，因审片方认为集数太多才删掉24集，包括五阿哥的病情、嘉妃下线真相、尔晴孩子的生父、袁春望身世、魏璎宁和高贵妃的谜样交情，部分剧迷挖出已完结的原著小说、番外篇，才解开这5大谜团。
五阿哥永琪去哪了？
在69集中，令妃意外遭毒虫咬伤，幸好有傅恒帮她取得解药，却没有演出永琪脚被咬伤后，是否有让病情加剧？余韵圣心草有没有给五阿哥吃？对此，网友表示番外篇有解释他隔年就去世了，得年25岁，但就历史记载，他的死因和皇子争宠无关，「王患附骨疮，不得溃，昨冬病中受封，今三月薨逝。」后人猜测可能他从小就开始训练骑马射箭，经常在野外活动，而野外变化极大的气温和环境，让他不慎染上此慢性病，加上当时医学不够发达，错过了治疗的最佳时机。
嘉妃下线真相
顺嫔被继后等后宫嫔妃陷害后，决定主动出击，趁小嘉嫔在御花园假山休息、十二阿哥在假山下玩耍时，对山石动了手脚，造成石头脱落差点砸伤十二阿哥的意外。皇帝和继后因此迁怒于小嘉嫔，将她打入冷宫从此下线。顺嫔也因为使用苦肉计，为救十二阿哥而被山石砸伤，借此与继后站在同一战线，可说是非常精彩的剧情。
尔晴孩子的生父
尔晴声称怀了龙种，但番外篇有交代小孩其实是和傅恒的弟弟傅谦所生，福康安长大后想找魏璎珞报杀母之仇，更不惜利用魏璎珞的女儿昭华公主对自己的感情，幸好最后璎珞用计逼傅谦对他说出真相，父子相认，他才明白妈妈恶毒和傅恒的无奈，放下了仇恨。
袁春望身世
在最后一集中，太后反驳了袁春望是先帝血脉的说法，有网友分析她是为了隐瞒当年“杀钱式夺乾隆”的真相才说谎，有可能是她对钱氏有愧、不敢轻易断送皇室血脉，才放过袁一命。而饰演袁春望的王茂蕾也在微博承认：「袁春望真的是先帝野外私生子，太后的表演说明了一切。」这才解答了众人疑惑。
魏璎宁和高贵妃的交情
事实上，高贵妃刚进宫时地位不高，一点都不嚣张跋扈，只是个热爱唱戏的妃子，有天偶然撞见被欺负的宫女魏璎宁，不由得想起从小没有妈妈照顾、备受后母欺负的往事，于是产生怜悯之情，叮咛对方如果有何不开心都能去储秀宫找她。只可惜这段与主线关系不够紧密，最后未能播出，否则高贵妃的形象应该会更加立体。
