自然交配
优势：
1、牵着种公牛走一圈便可以知道哪头母牛发情了，省去发情鉴定过程。
2、很多地区相对落后，没有配种员，没人会人工授精。
弊端：
1、养牛户的种公牛质量往往不如专门生产冻精的种公牛，因此所繁殖的牛犊品种质量可能稍差一些。
2、种公牛本交配种的过程中，较容易传播一些疾病。
3、种公牛饲养成本较高，特别所养母牛数量较少的情况下极为不划算。
4.在自然交配中，公母交配的环境比较开阔，交配玩可以随意走动，把精液都排出体外的比较多。而且会近亲繁殖，更有的是精子质量不成熟就交配了，减低了授精率。
人工授精
优势：
1、人工授精可能充分利用优秀种公牛，本交的情况下一头种公牛只能配50~80头母牛，而人工授精的情况下一头种公牛可以配数千头甚至更多的母牛，可最大程度提高种公牛的利用率和配种数量。
2、一头种公牛每年需要3000~5000元的饲养成本，而国产冻精售价仅10~20元/剂，进口冻精售价一般也不会超过50元/剂，相比而言人工授精成本更低。
3、人工授精可在一定程度上避免疾病的传播，例如布病、衣原体等。
4.在人工授精中，我们一般采用定位栏的方式，让禽畜牧不能乱动，人员也安全！
弊端：
1、人工授精对技术有一定的要求，只有经过专门培训的配种员才能保证良好的配种受胎率，部分地区缺少专业配种员，或者配种员要价过高，养牛户不得不选择公牛本交的配种方式。
2、初产母牛或母牛体型较小（绝大数中国黄牛体型都小）的情况下，选择人工授精可能造成难产，因为大部分用于生产冻精的种公牛个体都较大。
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